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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.235523Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 285 / 3259021 26 / 403641 212 / 25718729 4 / 491920 285 / 3259021 26 / 403641 212 / 25718729 4 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 9 / 38915 --   -- 9 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 2 / 100926 -- 1 / 103390 -- 2 / 100926 -- 1 / 103390 --
brain 14 / 261599 1 / 2128 18 / 7554651 -- 14 / 261599 1 / 2128 18 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 -- 6 / 233710   1 / 56549 -- 6 / 233710 0 / 43127
cerebrum 27 / 228104 -- -- -- 27 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804   -- -- 1 / 51804 0 / 689 -- --
ear 2 / 39315 -- -- -- 2 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 50 / 718928   21 / 2760977 -- 50 / 718928 0 / 9837 21 / 2760977 --
endocrine 1 / 2473 -- -- -- 1 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 5 / 211918 -- -- -- 5 / 211918 --
eye 11 / 94929 -- 1 / 138066 -- 11 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 4 / 548222 -- 0 / 34979 -- 4 / 548222 --
heart   -- 13 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 13 / 1231698 --
kidney 7 / 121184   8 / 1415985 -- 7 / 121184 0 / 2215 8 / 1415985 --
limb   -- 1 / 595880 -- 0 / 16187 -- 1 / 595880 --
liver 5 / 104633   8 / 527425 -- 5 / 104633 0 / 6685 8 / 527425 --
lung 4 / 26861 3 / 72516 16 / 943009 -- 4 / 26861 3 / 72516 16 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 1 / 344354 -- 1 / 14648 -- 1 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 1 / 85464 18 / 216846 14 / 960632 2 / 178606 1 / 85464 18 / 216846 14 / 960632 2 / 178606
muscle   -- 1 / 137075 -- 0 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary 35 / 43149 --   -- 35 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas 2 / 75220   9 / 1338446 -- 2 / 75220 0 / 34 9 / 1338446 --
pancreatic islet 2 / 30771 -- -- -- 2 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 1 / 9981 -- -- -- 1 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 3 / 292212 -- 2 / 37653 -- 3 / 292212 --
pooled tissue 9 / 99675 -- -- -- 9 / 99675 -- -- --
prostate     1 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 1 / 386047 --
retina 5 / 82470 -- 9 / 636203 -- 5 / 82470 -- 9 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 27 / 85891 4 / 31511 10 / 615945   27 / 85891 4 / 31511 10 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     10 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 10 / 386635 --
stem cell -- -- 4 / 234473 -- -- -- 4 / 234473 --
stomach   -- 2 / 218318 -- 0 / 21241 -- 2 / 218318 --
synovium 12 / 16875 -- -- -- 12 / 16875 -- -- --
testis 5 / 116987   5 / 736319 -- 5 / 116987 0 / 2634 5 / 736319 --
thymus 6 / 100203   7 / 346181 -- 6 / 100203 0 / 20273 7 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 42 / 262740     -- 42 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 2 / 206823 -- 0 / 6854 -- 2 / 206823 --
vascular   -- 12 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 12 / 1092595 --
white blood cells -- -- 6 / 398838 -- -- -- 6 / 398838 --
whole body -- -- 13 / 531904 2 / 212613 -- -- 13 / 531904 2 / 212613