Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.235195Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 74 / 3259021   296 / 25718729 6 / 491920 74 / 3259021 0 / 403641 296 / 25718729 6 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   -- 10 / 103390 -- 0 / 100926 -- 10 / 103390 --
brain 25 / 261599   38 / 7554651 -- 25 / 261599 0 / 2128 38 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 3 / 56549 -- 1 / 233710   3 / 56549 -- 1 / 233710 0 / 43127
cerebrum 8 / 228104 -- -- -- 8 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 7 / 51804   -- -- 7 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 11 / 718928   9 / 2760977 -- 11 / 718928 0 / 9837 9 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye   --   -- 0 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract 3 / 34979 -- 5 / 548222 -- 3 / 34979 -- 5 / 548222 --
heart   -- 1 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 1 / 1231698 --
kidney 1 / 121184   4 / 1415985 -- 1 / 121184 0 / 2215 4 / 1415985 --
limb   -- 2 / 595880 -- 0 / 16187 -- 2 / 595880 --
liver     6 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 6 / 527425 --
lung     7 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 7 / 943009 --
lymph node   -- 5 / 344354 -- 0 / 14648 -- 5 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland     28 / 960632 1 / 178606 0 / 85464 0 / 216846 28 / 960632 1 / 178606
muscle   -- 1 / 137075 -- 0 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous 5 / 35780 -- -- -- 5 / 35780 -- -- --
ovary   --   -- 0 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas 1 / 75220   11 / 1338446 -- 1 / 75220 0 / 34 11 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta   -- 6 / 292212 -- 0 / 37653 -- 6 / 292212 --
pooled tissue 2 / 99675 -- -- -- 2 / 99675 -- -- --
prostate     9 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 9 / 386047 --
retina   -- 1 / 636203 -- 0 / 82470 -- 1 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     7 / 615945 2 / 57574 0 / 85891 0 / 31511 7 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen       -- 0 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- -- 3 / 234473 -- -- -- 3 / 234473 --
stomach 2 / 21241 -- 1 / 218318 -- 2 / 21241 -- 1 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     1 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 1 / 736319 --
thymus       -- 0 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 3 / 262740   2 / 25954 -- 3 / 262740 0 / 14058 2 / 25954 --
uterus   -- 1 / 206823 -- 0 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular   -- 125 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 125 / 1092595 --
white blood cells -- -- 3 / 398838 -- -- -- 3 / 398838 --
whole body -- -- 8 / 531904 3 / 212613 -- -- 8 / 531904 3 / 212613