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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.23503Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 146 / 3259021 15 / 403641 320 / 25718729 2 / 491920 146 / 3259021 15 / 403641 320 / 25718729 2 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 -- 3 / 64924 -- 2 / 38915 -- 3 / 64924 --
bone marrow 3 / 100926 --   -- 3 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 5 / 261599   52 / 7554651 -- 5 / 261599 0 / 2128 52 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 4 / 56549 -- 2 / 233710   4 / 56549 -- 2 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 3 / 39315 -- -- -- 3 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 50 / 718928 2 / 9837 61 / 2760977 -- 50 / 718928 2 / 9837 61 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 4 / 211918 -- -- -- 4 / 211918 --
eye 3 / 94929 -- 5 / 138066 -- 3 / 94929 -- 5 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 17 / 548222 -- 0 / 34979 -- 17 / 548222 --
heart   -- 28 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 28 / 1231698 --
kidney     21 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 21 / 1415985 --
limb   -- 19 / 595880 -- 0 / 16187 -- 19 / 595880 --
liver 4 / 104633   1 / 527425 -- 4 / 104633 0 / 6685 1 / 527425 --
lung 2 / 26861 2 / 72516 18 / 943009 -- 2 / 26861 2 / 72516 18 / 943009 --
lymph node   -- 5 / 344354 -- 0 / 14648 -- 5 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 5 / 85464 11 / 216846 4 / 960632   5 / 85464 11 / 216846 4 / 960632 0 / 178606
muscle   -- 4 / 137075 -- 0 / 24130 -- 4 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary 5 / 43149 -- 5 / 354066 -- 5 / 43149 -- 5 / 354066 --
pancreas     10 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 10 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 6 / 99675 -- -- -- 6 / 99675 -- -- --
prostate     3 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 3 / 386047 --
retina 5 / 82470 -- 3 / 636203 -- 5 / 82470 -- 3 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 9 / 85891   4 / 615945   9 / 85891 0 / 31511 4 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 4 / 73492   9 / 386635 -- 4 / 73492 0 / 17831 9 / 386635 --
stem cell -- -- 6 / 234473 -- -- -- 6 / 234473 --
stomach 4 / 21241 -- 1 / 218318 -- 4 / 21241 -- 1 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 5 / 116987   4 / 736319 -- 5 / 116987 0 / 2634 4 / 736319 --
thymus 15 / 100203   14 / 346181 -- 15 / 100203 0 / 20273 14 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 10 / 262740     -- 10 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 2 / 206823 -- 0 / 6854 -- 2 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 9 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 9 / 1092595 --
white blood cells -- -- 4 / 398838 -- -- -- 4 / 398838 --
whole body -- -- 1 / 531904 2 / 212613 -- -- 1 / 531904 2 / 212613