Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.232525Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 120 / 3259021 10 / 403641 879 / 25718729 6 / 491920 120 / 3259021 10 / 403641 879 / 25718729 6 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 2 / 64924 -- 0 / 38915 -- 2 / 64924 --
bone marrow   -- 2 / 103390 -- 0 / 100926 -- 2 / 103390 --
brain 13 / 261599   250 / 7554651 -- 13 / 261599 0 / 2128 250 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 -- 2 / 233710   1 / 56549 -- 2 / 233710 0 / 43127
cerebrum 6 / 228104 -- -- -- 6 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 5 / 51804   -- -- 5 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 34 / 718928   134 / 2760977 -- 34 / 718928 0 / 9837 134 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 21 / 94929 -- 10 / 138066 -- 21 / 94929 -- 10 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 22 / 548222 -- 0 / 34979 -- 22 / 548222 --
heart   -- 30 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 30 / 1231698 --
kidney 1 / 121184   34 / 1415985 -- 1 / 121184 0 / 2215 34 / 1415985 --
limb 2 / 16187 -- 34 / 595880 -- 2 / 16187 -- 34 / 595880 --
liver 1 / 104633   4 / 527425 -- 1 / 104633 0 / 6685 4 / 527425 --
lung 1 / 26861 7 / 72516 44 / 943009 -- 1 / 26861 7 / 72516 44 / 943009 --
lymph node   -- 7 / 344354 -- 0 / 14648 -- 7 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 7 / 85464 3 / 216846 37 / 960632 3 / 178606 7 / 85464 3 / 216846 37 / 960632 3 / 178606
muscle   -- 13 / 137075 -- 0 / 24130 -- 13 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 -- 11 / 354066 -- 1 / 43149 -- 11 / 354066 --
pancreas     45 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 45 / 1338446 --
pancreatic islet 1 / 30771 -- -- -- 1 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 6 / 145854 -- 0 / 17986 -- 6 / 145854 --
placenta   -- 10 / 292212 -- 0 / 37653 -- 10 / 292212 --
pooled tissue 5 / 99675 -- -- -- 5 / 99675 -- -- --
prostate     11 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 11 / 386047 --
retina 2 / 82470 -- 7 / 636203 -- 2 / 82470 -- 7 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 1 / 85891   31 / 615945 1 / 57574 1 / 85891 0 / 31511 31 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 6 / 73492   17 / 386635 -- 6 / 73492 0 / 17831 17 / 386635 --
stem cell -- -- 2 / 234473 -- -- -- 2 / 234473 --
stomach   -- 2 / 218318 -- 0 / 21241 -- 2 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis 1 / 116987   27 / 736319 -- 1 / 116987 0 / 2634 27 / 736319 --
thymus     7 / 346181 -- 0 / 100203 0 / 20273 7 / 346181 --
thyroid 3 / 8821 -- -- -- 3 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 6 / 262740     -- 6 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 12 / 206823 -- 1 / 6854 -- 12 / 206823 --
vascular   -- 49 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 49 / 1092595 --
white blood cells -- -- 4 / 398838 -- -- -- 4 / 398838 --
whole body -- -- 12 / 531904 2 / 212613 -- -- 12 / 531904 2 / 212613