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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.229332Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 140 / 3259021 12 / 403641 313 / 25718729 7 / 491920 140 / 3259021 12 / 403641 313 / 25718729 7 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 6 / 261599   23 / 7554651 -- 6 / 261599 0 / 2128 23 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 6 / 56549 --     6 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 11 / 228104 -- -- -- 11 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804   -- -- 1 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 18 / 718928   25 / 2760977 -- 18 / 718928 0 / 9837 25 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 3 / 94929 -- 3 / 138066 -- 3 / 94929 -- 3 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 5 / 548222 -- 0 / 34979 -- 5 / 548222 --
heart 2 / 49793 -- 11 / 1231698 -- 2 / 49793 -- 11 / 1231698 --
kidney 2 / 121184   37 / 1415985 -- 2 / 121184 0 / 2215 37 / 1415985 --
limb   -- 3 / 595880 -- 0 / 16187 -- 3 / 595880 --
liver 7 / 104633   2 / 527425 -- 7 / 104633 0 / 6685 2 / 527425 --
lung 1 / 26861 7 / 72516 15 / 943009 -- 1 / 26861 7 / 72516 15 / 943009 --
lymph node   -- 2 / 344354 -- 0 / 14648 -- 2 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 1 / 85464 1 / 216846 19 / 960632 2 / 178606 1 / 85464 1 / 216846 19 / 960632 2 / 178606
muscle   -- 1 / 137075 -- 0 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary   -- 5 / 354066 -- 0 / 43149 -- 5 / 354066 --
pancreas     14 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 14 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   -- 1 / 292212 -- 0 / 37653 -- 1 / 292212 --
pooled tissue 4 / 99675 -- -- -- 4 / 99675 -- -- --
prostate     8 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 8 / 386047 --
retina 2 / 82470 -- 7 / 636203 -- 2 / 82470 -- 7 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 5 / 85891 4 / 31511 13 / 615945 1 / 57574 5 / 85891 4 / 31511 13 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 1 / 73492   4 / 386635 -- 1 / 73492 0 / 17831 4 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   -- 8 / 218318 -- 0 / 21241 -- 8 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 43 / 116987   77 / 736319 -- 43 / 116987 0 / 2634 77 / 736319 --
thymus 17 / 100203   8 / 346181 -- 17 / 100203 0 / 20273 8 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 5 / 262740     -- 5 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 9 / 206823 -- 1 / 6854 -- 9 / 206823 --
vascular 3 / 12366 -- 8 / 1092595 -- 3 / 12366 -- 8 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 4 / 531904 4 / 212613 -- -- 4 / 531904 4 / 212613