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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.2289Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 133 / 3259021 8 / 403641 17 / 25718729   133 / 3259021 8 / 403641 17 / 25718729 0 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 1 / 64924 -- 0 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow 1 / 100926 --   -- 1 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 18 / 261599   2 / 7554651 -- 18 / 261599 0 / 2128 2 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 3 / 56549 -- 1 / 233710   3 / 56549 -- 1 / 233710 0 / 43127
cerebrum 1 / 228104 -- -- -- 1 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 4 / 39315 -- -- -- 4 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 37 / 718928   2 / 2760977 -- 37 / 718928 0 / 9837 2 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 3 / 94929 -- 1 / 138066 -- 3 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract   --   -- 0 / 34979 -- 0 / 548222 --
heart 2 / 49793 -- 1 / 1231698 -- 2 / 49793 -- 1 / 1231698 --
kidney       -- 0 / 121184 0 / 2215 0 / 1415985 --
limb   --   -- 0 / 16187 -- 0 / 595880 --
liver     1 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 1 / 527425 --
lung 1 / 26861 3 / 72516   -- 1 / 26861 3 / 72516 0 / 943009 --
lymph node 3 / 14648 --   -- 3 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland   5 / 216846     0 / 85464 5 / 216846 0 / 960632 0 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 --   -- 1 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas 4 / 75220     -- 4 / 75220 0 / 34 0 / 1338446 --
pancreatic islet 4 / 30771 -- -- -- 4 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 4 / 9981 -- -- -- 4 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 --   -- 1 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta 1 / 37653 --   -- 1 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 9 / 99675 -- -- -- 9 / 99675 -- -- --
prostate     1 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 1 / 386047 --
retina 11 / 82470 --   -- 11 / 82470 -- 0 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 2 / 85891       2 / 85891 0 / 31511 0 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 8 / 73492     -- 8 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   -- 2 / 218318 -- 0 / 21241 -- 2 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 4 / 116987   2 / 736319 -- 4 / 116987 0 / 2634 2 / 736319 --
thymus 5 / 100203     -- 5 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 6 / 262740     -- 6 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   -- 3 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 3 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- --     -- -- 0 / 531904 0 / 212613