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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.22665Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 406 / 3259021 51 / 403641 1799 / 25718729 49 / 491920 406 / 3259021 51 / 403641 1799 / 25718729 49 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 6 / 38915 --   -- 6 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 1 / 100926 -- 4 / 103390 -- 1 / 100926 -- 4 / 103390 --
brain 32 / 261599   661 / 7554651 -- 32 / 261599 0 / 2128 661 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 4 / 56549 -- 31 / 233710 12 / 43127 4 / 56549 -- 31 / 233710 12 / 43127
cerebrum 102 / 228104 -- -- -- 102 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 2 / 51804   -- -- 2 / 51804 0 / 689 -- --
ear 5 / 39315 -- -- -- 5 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 49 / 718928 4 / 9837 106 / 2760977 -- 49 / 718928 4 / 9837 106 / 2760977 --
endocrine 1 / 2473 -- -- -- 1 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 23 / 211918 -- -- -- 23 / 211918 --
eye 11 / 94929 -- 10 / 138066 -- 11 / 94929 -- 10 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 31 / 548222 -- 0 / 34979 -- 31 / 548222 --
heart 21 / 49793 -- 68 / 1231698 -- 21 / 49793 -- 68 / 1231698 --
kidney 7 / 121184   54 / 1415985 -- 7 / 121184 0 / 2215 54 / 1415985 --
limb 10 / 16187 -- 33 / 595880 -- 10 / 16187 -- 33 / 595880 --
liver 7 / 104633   12 / 527425 -- 7 / 104633 0 / 6685 12 / 527425 --
lung 1 / 26861 7 / 72516 61 / 943009 -- 1 / 26861 7 / 72516 61 / 943009 --
lymph node   -- 14 / 344354 -- 0 / 14648 -- 14 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 5 / 85464 30 / 216846 59 / 960632 11 / 178606 5 / 85464 30 / 216846 59 / 960632 11 / 178606
muscle 3 / 24130 -- 6 / 137075 -- 3 / 24130 -- 6 / 137075 --
nervous 6 / 35780 -- -- -- 6 / 35780 -- -- --
ovary   -- 10 / 354066 -- 0 / 43149 -- 10 / 354066 --
pancreas 8 / 75220   71 / 1338446 -- 8 / 75220 0 / 34 71 / 1338446 --
pancreatic islet 3 / 30771 -- -- -- 3 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 1 / 9981 -- -- -- 1 / 9981 -- -- --
pineal gland 1 / 3907 -- -- -- 1 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 6 / 145854 -- 0 / 17986 -- 6 / 145854 --
placenta 3 / 37653 -- 5 / 292212 -- 3 / 37653 -- 5 / 292212 --
pooled tissue 10 / 99675 -- -- -- 10 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   21 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 21 / 386047 --
retina 22 / 82470 -- 149 / 636203 -- 22 / 82470 -- 149 / 636203 --
salivary gland 5 / 18434   -- -- 5 / 18434 0 / 958 -- --
skin 19 / 85891 8 / 31511 53 / 615945   19 / 85891 8 / 31511 53 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 11 / 73492   24 / 386635 -- 11 / 73492 0 / 17831 24 / 386635 --
stem cell -- -- 7 / 234473 -- -- -- 7 / 234473 --
stomach 1 / 21241 -- 5 / 218318 -- 1 / 21241 -- 5 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 5 / 116987   41 / 736319 -- 5 / 116987 0 / 2634 41 / 736319 --
thymus 3 / 100203   7 / 346181 -- 3 / 100203 0 / 20273 7 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 37 / 262740 2 / 14058 1 / 25954 -- 37 / 262740 2 / 14058 1 / 25954 --
uterus   -- 7 / 206823 -- 0 / 6854 -- 7 / 206823 --
vascular 2 / 12366 -- 182 / 1092595 -- 2 / 12366 -- 182 / 1092595 --
white blood cells -- -- 17 / 398838 -- -- -- 17 / 398838 --
whole body -- -- 20 / 531904 26 / 212613 -- -- 20 / 531904 26 / 212613