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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.2258Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 620 / 3259021   4504 / 25718729   620 / 3259021 0 / 403641 4504 / 25718729 0 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain     2 / 7554651 -- 0 / 261599 0 / 2128 2 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   --     0 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 58 / 718928     -- 58 / 718928 0 / 9837 0 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye   --   -- 0 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 --   -- 1 / 34979 -- 0 / 548222 --
heart 12 / 49793 --   -- 12 / 49793 -- 0 / 1231698 --
kidney       -- 0 / 121184 0 / 2215 0 / 1415985 --
limb   --   -- 0 / 16187 -- 0 / 595880 --
liver 1 / 104633     -- 1 / 104633 0 / 6685 0 / 527425 --
lung 317 / 26861   4486 / 943009 -- 317 / 26861 0 / 72516 4486 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland     1 / 960632   0 / 85464 0 / 216846 1 / 960632 0 / 178606
muscle 1 / 24130 --   -- 1 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   -- 1 / 354066 -- 0 / 43149 -- 1 / 354066 --
pancreas 1 / 75220   2 / 1338446 -- 1 / 75220 0 / 34 2 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 198 / 99675 -- -- -- 198 / 99675 -- -- --
prostate       -- 0 / 23701 0 / 5 0 / 386047 --
retina   --   -- 0 / 82470 -- 0 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     2 / 615945   0 / 85891 0 / 31511 2 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen       -- 0 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach 5 / 21241 --   -- 5 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis       -- 0 / 116987 0 / 2634 0 / 736319 --
thymus       -- 0 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 23 / 262740     -- 23 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus 3 / 6854 --   -- 3 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   -- 6 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 6 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 4 / 531904   -- -- 4 / 531904 0 / 212613