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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.22547Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 310 / 3259021 27 / 403641 1342 / 25718729 5 / 491920 310 / 3259021 27 / 403641 1342 / 25718729 5 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 -- 5 / 64924 -- 2 / 38915 -- 5 / 64924 --
bone marrow 67 / 100926 -- 8 / 103390 -- 67 / 100926 -- 8 / 103390 --
brain 14 / 261599   319 / 7554651 -- 14 / 261599 0 / 2128 319 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 10 / 56549 -- 7 / 233710   10 / 56549 -- 7 / 233710 0 / 43127
cerebrum 8 / 228104 -- -- -- 8 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 3 / 51804   -- -- 3 / 51804 0 / 689 -- --
ear 2 / 39315 -- -- -- 2 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 68 / 718928   154 / 2760977 -- 68 / 718928 0 / 9837 154 / 2760977 --
endocrine 1 / 2473 -- -- -- 1 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 6 / 211918 -- -- -- 6 / 211918 --
eye 8 / 94929 -- 6 / 138066 -- 8 / 94929 -- 6 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 24 / 548222 -- 0 / 34979 -- 24 / 548222 --
heart 2 / 49793 -- 32 / 1231698 -- 2 / 49793 -- 32 / 1231698 --
kidney 7 / 121184   89 / 1415985 -- 7 / 121184 0 / 2215 89 / 1415985 --
limb 5 / 16187 -- 37 / 595880 -- 5 / 16187 -- 37 / 595880 --
liver 3 / 104633   12 / 527425 -- 3 / 104633 0 / 6685 12 / 527425 --
lung 2 / 26861 10 / 72516 87 / 943009 -- 2 / 26861 10 / 72516 87 / 943009 --
lymph node 7 / 14648 -- 24 / 344354 -- 7 / 14648 -- 24 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 6 / 85464 12 / 216846 54 / 960632   6 / 85464 12 / 216846 54 / 960632 0 / 178606
muscle   -- 9 / 137075 -- 0 / 24130 -- 9 / 137075 --
nervous 4 / 35780 -- -- -- 4 / 35780 -- -- --
ovary 2 / 43149 -- 26 / 354066 -- 2 / 43149 -- 26 / 354066 --
pancreas 1 / 75220   106 / 1338446 -- 1 / 75220 0 / 34 106 / 1338446 --
pancreatic islet 1 / 30771 -- -- -- 1 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 2 / 17986 -- 17 / 145854 -- 2 / 17986 -- 17 / 145854 --
placenta 5 / 37653 -- 7 / 292212 -- 5 / 37653 -- 7 / 292212 --
pooled tissue 10 / 99675 -- -- -- 10 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   18 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 18 / 386047 --
retina 2 / 82470 -- 8 / 636203 -- 2 / 82470 -- 8 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434   -- -- 1 / 18434 0 / 958 -- --
skin 8 / 85891 4 / 31511 34 / 615945 2 / 57574 8 / 85891 4 / 31511 34 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 4 / 73492 1 / 17831 16 / 386635 -- 4 / 73492 1 / 17831 16 / 386635 --
stem cell -- -- 22 / 234473 -- -- -- 22 / 234473 --
stomach   -- 6 / 218318 -- 0 / 21241 -- 6 / 218318 --
synovium 2 / 16875 -- -- -- 2 / 16875 -- -- --
testis 17 / 116987   74 / 736319 -- 17 / 116987 0 / 2634 74 / 736319 --
thymus 6 / 100203   9 / 346181 -- 6 / 100203 0 / 20273 9 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 23 / 262740     -- 23 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus 2 / 6854 -- 11 / 206823 -- 2 / 6854 -- 11 / 206823 --
vascular 2 / 12366 -- 96 / 1092595 -- 2 / 12366 -- 96 / 1092595 --
white blood cells -- -- 2 / 398838 -- -- -- 2 / 398838 --
whole body -- -- 17 / 531904 3 / 212613 -- -- 17 / 531904 3 / 212613