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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.22530Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 249 / 3259021 38 / 403641 1293 / 25718729 17 / 491920 249 / 3259021 38 / 403641 1293 / 25718729 17 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 -- 3 / 64924 -- 2 / 38915 -- 3 / 64924 --
bone marrow 1 / 100926 -- 1 / 103390 -- 1 / 100926 -- 1 / 103390 --
brain 27 / 261599   362 / 7554651 -- 27 / 261599 0 / 2128 362 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 8 / 56549 -- 29 / 233710 5 / 43127 8 / 56549 -- 29 / 233710 5 / 43127
cerebrum 72 / 228104 -- -- -- 72 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 2 / 51804   -- -- 2 / 51804 0 / 689 -- --
ear 2 / 39315 -- -- -- 2 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 33 / 718928   155 / 2760977 -- 33 / 718928 0 / 9837 155 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 10 / 211918 -- -- -- 10 / 211918 --
eye 7 / 94929 -- 4 / 138066 -- 7 / 94929 -- 4 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 24 / 548222 -- 0 / 34979 -- 24 / 548222 --
heart 4 / 49793 -- 46 / 1231698 -- 4 / 49793 -- 46 / 1231698 --
kidney 5 / 121184   75 / 1415985 -- 5 / 121184 0 / 2215 75 / 1415985 --
limb 5 / 16187 -- 30 / 595880 -- 5 / 16187 -- 30 / 595880 --
liver 2 / 104633   7 / 527425 -- 2 / 104633 0 / 6685 7 / 527425 --
lung 2 / 26861 12 / 72516 72 / 943009 -- 2 / 26861 12 / 72516 72 / 943009 --
lymph node   -- 18 / 344354 -- 0 / 14648 -- 18 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 4 / 85464 19 / 216846 32 / 960632 8 / 178606 4 / 85464 19 / 216846 32 / 960632 8 / 178606
muscle 1 / 24130 -- 12 / 137075 -- 1 / 24130 -- 12 / 137075 --
nervous 6 / 35780 -- -- -- 6 / 35780 -- -- --
ovary   -- 16 / 354066 -- 0 / 43149 -- 16 / 354066 --
pancreas 5 / 75220   46 / 1338446 -- 5 / 75220 0 / 34 46 / 1338446 --
pancreatic islet 2 / 30771 -- -- -- 2 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 9 / 145854 -- 0 / 17986 -- 9 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 16 / 292212 -- 2 / 37653 -- 16 / 292212 --
pooled tissue 6 / 99675 -- -- -- 6 / 99675 -- -- --
prostate     25 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 25 / 386047 --
retina 5 / 82470 -- 76 / 636203 -- 5 / 82470 -- 76 / 636203 --
salivary gland 2 / 18434   -- -- 2 / 18434 0 / 958 -- --
skin 6 / 85891   34 / 615945 1 / 57574 6 / 85891 0 / 31511 34 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 7 / 73492 6 / 17831 13 / 386635 -- 7 / 73492 6 / 17831 13 / 386635 --
stem cell -- -- 2 / 234473 -- -- -- 2 / 234473 --
stomach 3 / 21241 -- 8 / 218318 -- 3 / 21241 -- 8 / 218318 --
synovium 2 / 16875 -- -- -- 2 / 16875 -- -- --
testis 4 / 116987   42 / 736319 -- 4 / 116987 0 / 2634 42 / 736319 --
thymus 4 / 100203   38 / 346181 -- 4 / 100203 0 / 20273 38 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 14 / 262740 1 / 14058 2 / 25954 -- 14 / 262740 1 / 14058 2 / 25954 --
uterus   -- 12 / 206823 -- 0 / 6854 -- 12 / 206823 --
vascular 3 / 12366 -- 51 / 1092595 -- 3 / 12366 -- 51 / 1092595 --
white blood cells -- -- 9 / 398838 -- -- -- 9 / 398838 --
whole body -- -- 14 / 531904 3 / 212613 -- -- 14 / 531904 3 / 212613