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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.22478Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 263 / 3259021 34 / 403641 943 / 25718729 11 / 491920 263 / 3259021 34 / 403641 943 / 25718729 11 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 3 / 38915 -- 2 / 64924 -- 3 / 38915 -- 2 / 64924 --
bone marrow 7 / 100926 -- 7 / 103390 -- 7 / 100926 -- 7 / 103390 --
brain 49 / 261599   239 / 7554651 -- 49 / 261599 0 / 2128 239 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 -- 16 / 233710 1 / 43127 1 / 56549 -- 16 / 233710 1 / 43127
cerebrum 7 / 228104 -- -- -- 7 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 3 / 51804   -- -- 3 / 51804 0 / 689 -- --
ear 6 / 39315 -- -- -- 6 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 50 / 718928 4 / 9837 167 / 2760977 -- 50 / 718928 4 / 9837 167 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 28 / 94929 -- 11 / 138066 -- 28 / 94929 -- 11 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 22 / 548222 -- 0 / 34979 -- 22 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 44 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 44 / 1231698 --
kidney 5 / 121184   43 / 1415985 -- 5 / 121184 0 / 2215 43 / 1415985 --
limb   -- 18 / 595880 -- 0 / 16187 -- 18 / 595880 --
liver 1 / 104633   11 / 527425 -- 1 / 104633 0 / 6685 11 / 527425 --
lung   6 / 72516 45 / 943009 -- 0 / 26861 6 / 72516 45 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 -- 18 / 344354 -- 2 / 14648 -- 18 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 6 / 85464 23 / 216846 15 / 960632 4 / 178606 6 / 85464 23 / 216846 15 / 960632 4 / 178606
muscle   -- 3 / 137075 -- 0 / 24130 -- 3 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 44 / 43149 -- 7 / 354066 -- 44 / 43149 -- 7 / 354066 --
pancreas 7 / 75220   33 / 1338446 -- 7 / 75220 0 / 34 33 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 4 / 145854 -- 0 / 17986 -- 4 / 145854 --
placenta 1 / 37653 -- 6 / 292212 -- 1 / 37653 -- 6 / 292212 --
pooled tissue 8 / 99675 -- -- -- 8 / 99675 -- -- --
prostate     7 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 7 / 386047 --
retina 6 / 82470 -- 23 / 636203 -- 6 / 82470 -- 23 / 636203 --
salivary gland 2 / 18434   -- -- 2 / 18434 0 / 958 -- --
skin     25 / 615945 2 / 57574 0 / 85891 0 / 31511 25 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 7 / 73492   22 / 386635 -- 7 / 73492 0 / 17831 22 / 386635 --
stem cell -- -- 17 / 234473 -- -- -- 17 / 234473 --
stomach   -- 5 / 218318 -- 0 / 21241 -- 5 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 1 / 116987   6 / 736319 -- 1 / 116987 0 / 2634 6 / 736319 --
thymus 4 / 100203   22 / 346181 -- 4 / 100203 0 / 20273 22 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 9 / 262740 1 / 14058   -- 9 / 262740 1 / 14058 0 / 25954 --
uterus 2 / 6854 -- 5 / 206823 -- 2 / 6854 -- 5 / 206823 --
vascular 2 / 12366 -- 59 / 1092595 -- 2 / 12366 -- 59 / 1092595 --
white blood cells -- -- 32 / 398838 -- -- -- 32 / 398838 --
whole body -- -- 8 / 531904 4 / 212613 -- -- 8 / 531904 4 / 212613