Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.22264Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 155 / 3259021 36 / 403641 635 / 25718729 14 / 491920 155 / 3259021 36 / 403641 635 / 25718729 14 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 --   -- 2 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 5 / 100926 -- 6 / 103390 -- 5 / 100926 -- 6 / 103390 --
brain 11 / 261599 2 / 2128 133 / 7554651 -- 11 / 261599 2 / 2128 133 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 2 / 56549 -- 4 / 233710   2 / 56549 -- 4 / 233710 0 / 43127
cerebrum 10 / 228104 -- -- -- 10 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 40 / 718928 1 / 9837 87 / 2760977 -- 40 / 718928 1 / 9837 87 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 8 / 211918 -- -- -- 8 / 211918 --
eye   -- 3 / 138066 -- 0 / 94929 -- 3 / 138066 --
gastrointestinal tract 5 / 34979 -- 16 / 548222 -- 5 / 34979 -- 16 / 548222 --
heart   -- 25 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 25 / 1231698 --
kidney 5 / 121184   45 / 1415985 -- 5 / 121184 0 / 2215 45 / 1415985 --
limb   -- 16 / 595880 -- 0 / 16187 -- 16 / 595880 --
liver 1 / 104633   19 / 527425 -- 1 / 104633 0 / 6685 19 / 527425 --
lung 2 / 26861 5 / 72516 30 / 943009 -- 2 / 26861 5 / 72516 30 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 19 / 344354 -- 1 / 14648 -- 19 / 344354 --
lymphoreticular   1 / 5421 -- -- 0 / 3137 1 / 5421 -- --
mammary gland 11 / 85464 16 / 216846 23 / 960632 6 / 178606 11 / 85464 16 / 216846 23 / 960632 6 / 178606
muscle 5 / 24130 -- 2 / 137075 -- 5 / 24130 -- 2 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 5 / 43149 -- 14 / 354066 -- 5 / 43149 -- 14 / 354066 --
pancreas 1 / 75220   27 / 1338446 -- 1 / 75220 0 / 34 27 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 -- 7 / 145854 -- 1 / 17986 -- 7 / 145854 --
placenta 4 / 37653 -- 6 / 292212 -- 4 / 37653 -- 6 / 292212 --
pooled tissue 7 / 99675 -- -- -- 7 / 99675 -- -- --
prostate     20 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 20 / 386047 --
retina 4 / 82470 -- 9 / 636203 -- 4 / 82470 -- 9 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 10 / 85891 3 / 31511 15 / 615945 4 / 57574 10 / 85891 3 / 31511 15 / 615945 4 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 1 / 73492 6 / 17831 5 / 386635 -- 1 / 73492 6 / 17831 5 / 386635 --
stem cell -- -- 7 / 234473 -- -- -- 7 / 234473 --
stomach   -- 7 / 218318 -- 0 / 21241 -- 7 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis   1 / 2634 14 / 736319 -- 0 / 116987 1 / 2634 14 / 736319 --
thymus 3 / 100203   14 / 346181 -- 3 / 100203 0 / 20273 14 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 17 / 262740 1 / 14058 1 / 25954 -- 17 / 262740 1 / 14058 1 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 3 / 206823 -- 1 / 6854 -- 3 / 206823 --
vascular   -- 28 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 28 / 1092595 --
white blood cells -- -- 8 / 398838 -- -- -- 8 / 398838 --
whole body -- -- 14 / 531904 4 / 212613 -- -- 14 / 531904 4 / 212613