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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.22183Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 269 / 3259021 18 / 403641 165 / 25718729   269 / 3259021 18 / 403641 165 / 25718729 0 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 22 / 38915 -- 1 / 64924 -- 22 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow 3 / 100926 --   -- 3 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 4 / 261599   18 / 7554651 -- 4 / 261599 0 / 2128 18 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 3 / 56549 -- 2 / 233710   3 / 56549 -- 2 / 233710 0 / 43127
cerebrum 2 / 228104 -- -- -- 2 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 5 / 51804   -- -- 5 / 51804 0 / 689 -- --
ear 11 / 39315 -- -- -- 11 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 28 / 718928   3 / 2760977 -- 28 / 718928 0 / 9837 3 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 2 / 94929 --   -- 2 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 6 / 548222 -- 0 / 34979 -- 6 / 548222 --
heart 2 / 49793 -- 5 / 1231698 -- 2 / 49793 -- 5 / 1231698 --
kidney 29 / 121184   38 / 1415985 -- 29 / 121184 0 / 2215 38 / 1415985 --
limb   -- 1 / 595880 -- 0 / 16187 -- 1 / 595880 --
liver 23 / 104633 5 / 6685 20 / 527425 -- 23 / 104633 5 / 6685 20 / 527425 --
lung 2 / 26861 1 / 72516 18 / 943009 -- 2 / 26861 1 / 72516 18 / 943009 --
lymph node   -- 3 / 344354 -- 0 / 14648 -- 3 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 12 / 85464 9 / 216846 13 / 960632   12 / 85464 9 / 216846 13 / 960632 0 / 178606
muscle   -- 2 / 137075 -- 0 / 24130 -- 2 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary   -- 3 / 354066 -- 0 / 43149 -- 3 / 354066 --
pancreas     9 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 9 / 1338446 --
pancreatic islet 3 / 30771 -- -- -- 3 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 2 / 17986 --   -- 2 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta 5 / 37653 --   -- 5 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 9 / 99675 -- -- -- 9 / 99675 -- -- --
prostate     4 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 4 / 386047 --
retina 1 / 82470 -- 2 / 636203 -- 1 / 82470 -- 2 / 636203 --
salivary gland 4 / 18434   -- -- 4 / 18434 0 / 958 -- --
skin 6 / 85891 3 / 31511 3 / 615945   6 / 85891 3 / 31511 3 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 17 / 73492   2 / 386635 -- 17 / 73492 0 / 17831 2 / 386635 --
stem cell -- -- 3 / 234473 -- -- -- 3 / 234473 --
stomach 3 / 21241 -- 3 / 218318 -- 3 / 21241 -- 3 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 3 / 116987   1 / 736319 -- 3 / 116987 0 / 2634 1 / 736319 --
thymus 14 / 100203     -- 14 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 31 / 262740     -- 31 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular 18 / 12366 -- 3 / 1092595 -- 18 / 12366 -- 3 / 1092595 --
white blood cells -- -- 1 / 398838 -- -- -- 1 / 398838 --
whole body -- --     -- -- 0 / 531904 0 / 212613