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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.21444Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 283 / 3259021 52 / 403641 2458 / 25718729 106 / 491920 283 / 3259021 52 / 403641 2458 / 25718729 106 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 3 / 64924 -- 0 / 38915 -- 3 / 64924 --
bone marrow 3 / 100926 -- 10 / 103390 -- 3 / 100926 -- 10 / 103390 --
brain 17 / 261599   827 / 7554651 -- 17 / 261599 0 / 2128 827 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 21 / 56549 -- 58 / 233710 7 / 43127 21 / 56549 -- 58 / 233710 7 / 43127
cerebrum 14 / 228104 -- -- -- 14 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 2 / 39315 -- -- -- 2 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 82 / 718928 1 / 9837 195 / 2760977 -- 82 / 718928 1 / 9837 195 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 10 / 211918 -- -- -- 10 / 211918 --
eye 3 / 94929 -- 3 / 138066 -- 3 / 94929 -- 3 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 50 / 548222 -- 1 / 34979 -- 50 / 548222 --
heart 7 / 49793 -- 107 / 1231698 -- 7 / 49793 -- 107 / 1231698 --
kidney 5 / 121184   58 / 1415985 -- 5 / 121184 0 / 2215 58 / 1415985 --
limb   -- 56 / 595880 -- 0 / 16187 -- 56 / 595880 --
liver 3 / 104633   42 / 527425 -- 3 / 104633 0 / 6685 42 / 527425 --
lung 7 / 26861 14 / 72516 72 / 943009 -- 7 / 26861 14 / 72516 72 / 943009 --
lymph node 4 / 14648 -- 10 / 344354 -- 4 / 14648 -- 10 / 344354 --
lymphoreticular   1 / 5421 -- -- 0 / 3137 1 / 5421 -- --
mammary gland 3 / 85464 26 / 216846 79 / 960632 65 / 178606 3 / 85464 26 / 216846 79 / 960632 65 / 178606
muscle 2 / 24130 -- 18 / 137075 -- 2 / 24130 -- 18 / 137075 --
nervous 2 / 35780 -- -- -- 2 / 35780 -- -- --
ovary 6 / 43149 -- 28 / 354066 -- 6 / 43149 -- 28 / 354066 --
pancreas 11 / 75220   126 / 1338446 -- 11 / 75220 0 / 34 126 / 1338446 --
pancreatic islet 2 / 30771 -- -- -- 2 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland 1 / 3907 -- -- -- 1 / 3907 -- -- --
pituitary gland 4 / 17986 -- 4 / 145854 -- 4 / 17986 -- 4 / 145854 --
placenta 3 / 37653 -- 11 / 292212 -- 3 / 37653 -- 11 / 292212 --
pooled tissue 8 / 99675 -- -- -- 8 / 99675 -- -- --
prostate 2 / 23701   24 / 386047 -- 2 / 23701 0 / 5 24 / 386047 --
retina 2 / 82470 -- 221 / 636203 -- 2 / 82470 -- 221 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434   -- -- 1 / 18434 0 / 958 -- --
skin 3 / 85891   93 / 615945 7 / 57574 3 / 85891 0 / 31511 93 / 615945 7 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 6 / 73492   37 / 386635 -- 6 / 73492 0 / 17831 37 / 386635 --
stem cell -- -- 12 / 234473 -- -- -- 12 / 234473 --
stomach 3 / 21241 -- 19 / 218318 -- 3 / 21241 -- 19 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 15 / 116987   68 / 736319 -- 15 / 116987 0 / 2634 68 / 736319 --
thymus 21 / 100203 9 / 20273 42 / 346181 -- 21 / 100203 9 / 20273 42 / 346181 --
thyroid 2 / 8821 -- -- -- 2 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 15 / 262740 1 / 14058 9 / 25954 -- 15 / 262740 1 / 14058 9 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 11 / 206823 -- 1 / 6854 -- 11 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 60 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 60 / 1092595 --
white blood cells -- -- 50 / 398838 -- -- -- 50 / 398838 --
whole body -- -- 45 / 531904 27 / 212613 -- -- 45 / 531904 27 / 212613