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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.2131Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 576 / 3259021 6 / 403641 3922 / 25718729 2 / 491920 576 / 3259021 6 / 403641 3922 / 25718729 2 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 1 / 38915 -- 2 / 64924 -- 1 / 38915 -- 2 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain     27 / 7554651 -- 0 / 261599 0 / 2128 27 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   --     0 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 4 / 228104 -- -- -- 4 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 15 / 51804   -- -- 15 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 8 / 718928   7 / 2760977 -- 8 / 718928 0 / 9837 7 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye   --   -- 0 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract 8 / 34979 -- 4 / 548222 -- 8 / 34979 -- 4 / 548222 --
heart   -- 2 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 2 / 1231698 --
kidney 12 / 121184 1 / 2215 97 / 1415985 -- 12 / 121184 1 / 2215 97 / 1415985 --
limb 2 / 16187 --   -- 2 / 16187 -- 0 / 595880 --
liver 10 / 104633   12 / 527425 -- 10 / 104633 0 / 6685 12 / 527425 --
lung 4 / 26861 1 / 72516 13 / 943009 -- 4 / 26861 1 / 72516 13 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 5 / 85464   3 / 960632   5 / 85464 0 / 216846 3 / 960632 0 / 178606
muscle 5 / 24130 --   -- 5 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   -- 2 / 354066 -- 0 / 43149 -- 2 / 354066 --
pancreas 334 / 75220   3691 / 1338446 -- 334 / 75220 0 / 34 3691 / 1338446 --
pancreatic islet 84 / 30771 -- -- -- 84 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   -- 1 / 292212 -- 0 / 37653 -- 1 / 292212 --
pooled tissue 12 / 99675 -- -- -- 12 / 99675 -- -- --
prostate     6 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 6 / 386047 --
retina   --   -- 0 / 82470 -- 0 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     2 / 615945 1 / 57574 0 / 85891 0 / 31511 2 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 2 / 73492 3 / 17831 4 / 386635 -- 2 / 73492 3 / 17831 4 / 386635 --
stem cell -- -- 1 / 234473 -- -- -- 1 / 234473 --
stomach 63 / 21241 --   -- 63 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     2 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 2 / 736319 --
thymus       -- 0 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 7 / 262740 1 / 14058   -- 7 / 262740 1 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   -- 3 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 3 / 1092595 --
white blood cells -- -- 32 / 398838 -- -- -- 32 / 398838 --
whole body -- -- 10 / 531904 1 / 212613 -- -- 10 / 531904 1 / 212613