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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.209903Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 271 / 3259021 19 / 403641 1038 / 25718729 28 / 491920 271 / 3259021 19 / 403641 1038 / 25718729 28 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 4 / 64924 -- 0 / 38915 -- 4 / 64924 --
bone marrow 49 / 100926 -- 2 / 103390 -- 49 / 100926 -- 2 / 103390 --
brain 29 / 261599 1 / 2128 247 / 7554651 -- 29 / 261599 1 / 2128 247 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 8 / 56549 -- 29 / 233710 8 / 43127 8 / 56549 -- 29 / 233710 8 / 43127
cerebrum 8 / 228104 -- -- -- 8 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 2 / 39315 -- -- -- 2 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 90 / 718928 2 / 9837 128 / 2760977 -- 90 / 718928 2 / 9837 128 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 2 / 211918 -- -- -- 2 / 211918 --
eye 20 / 94929 -- 4 / 138066 -- 20 / 94929 -- 4 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 29 / 548222 -- 0 / 34979 -- 29 / 548222 --
heart   -- 36 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 36 / 1231698 --
kidney 8 / 121184   62 / 1415985 -- 8 / 121184 0 / 2215 62 / 1415985 --
limb 1 / 16187 -- 16 / 595880 -- 1 / 16187 -- 16 / 595880 --
liver     16 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 16 / 527425 --
lung 3 / 26861 3 / 72516 35 / 943009 -- 3 / 26861 3 / 72516 35 / 943009 --
lymph node   -- 20 / 344354 -- 0 / 14648 -- 20 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 4 / 85464 13 / 216846 38 / 960632 10 / 178606 4 / 85464 13 / 216846 38 / 960632 10 / 178606
muscle   -- 8 / 137075 -- 0 / 24130 -- 8 / 137075 --
nervous 3 / 35780 -- -- -- 3 / 35780 -- -- --
ovary 3 / 43149 -- 21 / 354066 -- 3 / 43149 -- 21 / 354066 --
pancreas     47 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 47 / 1338446 --
pancreatic islet 2 / 30771 -- -- -- 2 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 3 / 9981 -- -- -- 3 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 -- 5 / 145854 -- 1 / 17986 -- 5 / 145854 --
placenta   -- 5 / 292212 -- 0 / 37653 -- 5 / 292212 --
pooled tissue 5 / 99675 -- -- -- 5 / 99675 -- -- --
prostate     29 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 29 / 386047 --
retina 1 / 82470 -- 58 / 636203 -- 1 / 82470 -- 58 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 2 / 85891   17 / 615945 5 / 57574 2 / 85891 0 / 31511 17 / 615945 5 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 4 / 73492   25 / 386635 -- 4 / 73492 0 / 17831 25 / 386635 --
stem cell -- -- 4 / 234473 -- -- -- 4 / 234473 --
stomach 3 / 21241 -- 12 / 218318 -- 3 / 21241 -- 12 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 3 / 116987   45 / 736319 -- 3 / 116987 0 / 2634 45 / 736319 --
thymus 3 / 100203   28 / 346181 -- 3 / 100203 0 / 20273 28 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 15 / 262740     -- 15 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 13 / 206823 -- 1 / 6854 -- 13 / 206823 --
vascular   -- 29 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 29 / 1092595 --
white blood cells -- -- 9 / 398838 -- -- -- 9 / 398838 --
whole body -- -- 15 / 531904 5 / 212613 -- -- 15 / 531904 5 / 212613