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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.205190Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 305 / 3259021 34 / 403641 526 / 25718729 3 / 491920 305 / 3259021 34 / 403641 526 / 25718729 3 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 --   -- 2 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 14 / 100926 -- 4 / 103390 -- 14 / 100926 -- 4 / 103390 --
brain 23 / 261599   255 / 7554651 -- 23 / 261599 0 / 2128 255 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 10 / 56549 -- 2 / 233710   10 / 56549 -- 2 / 233710 0 / 43127
cerebrum 37 / 228104 -- -- -- 37 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 58 / 718928   21 / 2760977 -- 58 / 718928 0 / 9837 21 / 2760977 --
endocrine 1 / 2473 -- -- -- 1 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 14 / 94929 -- 3 / 138066 -- 14 / 94929 -- 3 / 138066 --
gastrointestinal tract   --   -- 0 / 34979 -- 0 / 548222 --
heart 3 / 49793 -- 13 / 1231698 -- 3 / 49793 -- 13 / 1231698 --
kidney 18 / 121184   8 / 1415985 -- 18 / 121184 0 / 2215 8 / 1415985 --
limb 5 / 16187 -- 7 / 595880 -- 5 / 16187 -- 7 / 595880 --
liver 3 / 104633   1 / 527425 -- 3 / 104633 0 / 6685 1 / 527425 --
lung 4 / 26861 1 / 72516 6 / 943009 -- 4 / 26861 1 / 72516 6 / 943009 --
lymph node 3 / 14648 -- 8 / 344354 -- 3 / 14648 -- 8 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 4 / 85464 20 / 216846 11 / 960632   4 / 85464 20 / 216846 11 / 960632 0 / 178606
muscle   -- 2 / 137075 -- 0 / 24130 -- 2 / 137075 --
nervous 7 / 35780 -- -- -- 7 / 35780 -- -- --
ovary   -- 5 / 354066 -- 0 / 43149 -- 5 / 354066 --
pancreas 2 / 75220 1 / 34 42 / 1338446 -- 2 / 75220 1 / 34 42 / 1338446 --
pancreatic islet 1 / 30771 -- -- -- 1 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 4 / 17986 --   -- 4 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta 1 / 37653 -- 2 / 292212 -- 1 / 37653 -- 2 / 292212 --
pooled tissue 12 / 99675 -- -- -- 12 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   1 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 1 / 386047 --
retina 12 / 82470 -- 16 / 636203 -- 12 / 82470 -- 16 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 7 / 85891 6 / 31511 10 / 615945 2 / 57574 7 / 85891 6 / 31511 10 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 5 / 73492   9 / 386635 -- 5 / 73492 0 / 17831 9 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   -- 1 / 218318 -- 0 / 21241 -- 1 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 8 / 116987   7 / 736319 -- 8 / 116987 0 / 2634 7 / 736319 --
thymus 14 / 100203 4 / 20273 2 / 346181 -- 14 / 100203 4 / 20273 2 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 29 / 262740 2 / 14058   -- 29 / 262740 2 / 14058 0 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 1 / 206823 -- 1 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular   -- 49 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 49 / 1092595 --
white blood cells -- -- 30 / 398838 -- -- -- 30 / 398838 --
whole body -- -- 9 / 531904 1 / 212613 -- -- 9 / 531904 1 / 212613