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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.2024Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 30 / 3259021 8 / 403641 65 / 25718729   30 / 3259021 8 / 403641 65 / 25718729 0 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 2 / 64924 -- 0 / 38915 -- 2 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain     10 / 7554651 -- 0 / 261599 0 / 2128 10 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 2 / 233710   0 / 56549 -- 2 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 4 / 718928   13 / 2760977 -- 4 / 718928 0 / 9837 13 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 1 / 94929 --   -- 1 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 1 / 548222 -- 0 / 34979 -- 1 / 548222 --
heart   -- 5 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 5 / 1231698 --
kidney 4 / 121184   5 / 1415985 -- 4 / 121184 0 / 2215 5 / 1415985 --
limb   --   -- 0 / 16187 -- 0 / 595880 --
liver   2 / 6685   -- 0 / 104633 2 / 6685 0 / 527425 --
lung   1 / 72516 3 / 943009 -- 0 / 26861 1 / 72516 3 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland   2 / 216846 1 / 960632   0 / 85464 2 / 216846 1 / 960632 0 / 178606
muscle   -- 1 / 137075 -- 0 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   -- 1 / 354066 -- 0 / 43149 -- 1 / 354066 --
pancreas     2 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 2 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 --   -- 1 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue   -- -- -- 0 / 99675 -- -- --
prostate       -- 0 / 23701 0 / 5 0 / 386047 --
retina 3 / 82470 -- 3 / 636203 -- 3 / 82470 -- 3 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 5 / 85891   2 / 615945   5 / 85891 0 / 31511 2 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     1 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 1 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach 5 / 21241 -- 1 / 218318 -- 5 / 21241 -- 1 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     2 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 2 / 736319 --
thymus     4 / 346181 -- 0 / 100203 0 / 20273 4 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 2 / 262740 3 / 14058   -- 2 / 262740 3 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 1 / 206823 -- 0 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular 2 / 12366 -- 3 / 1092595 -- 2 / 12366 -- 3 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 1 / 531904   -- -- 1 / 531904 0 / 212613