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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.2018Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 318 / 3259021 67 / 403641 1491 / 25718729 8 / 491920 318 / 3259021 67 / 403641 1491 / 25718729 8 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 6 / 38915 -- 2 / 64924 -- 6 / 38915 -- 2 / 64924 --
bone marrow 35 / 100926 -- 4 / 103390 -- 35 / 100926 -- 4 / 103390 --
brain 17 / 261599 3 / 2128 306 / 7554651 -- 17 / 261599 3 / 2128 306 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 15 / 56549 -- 3 / 233710   15 / 56549 -- 3 / 233710 0 / 43127
cerebrum 3 / 228104 -- -- -- 3 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 6 / 51804   -- -- 6 / 51804 0 / 689 -- --
ear 4 / 39315 -- -- -- 4 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 63 / 718928 1 / 9837 243 / 2760977 -- 63 / 718928 1 / 9837 243 / 2760977 --
endocrine 1 / 2473 -- -- -- 1 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 19 / 211918 -- -- -- 19 / 211918 --
eye 7 / 94929 -- 7 / 138066 -- 7 / 94929 -- 7 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 39 / 548222 -- 1 / 34979 -- 39 / 548222 --
heart 5 / 49793 -- 92 / 1231698 -- 5 / 49793 -- 92 / 1231698 --
kidney 5 / 121184   80 / 1415985 -- 5 / 121184 0 / 2215 80 / 1415985 --
limb 1 / 16187 -- 66 / 595880 -- 1 / 16187 -- 66 / 595880 --
liver 8 / 104633 3 / 6685 18 / 527425 -- 8 / 104633 3 / 6685 18 / 527425 --
lung 4 / 26861 11 / 72516 64 / 943009 -- 4 / 26861 11 / 72516 64 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 38 / 344354 -- 1 / 14648 -- 38 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 7 / 85464 39 / 216846 25 / 960632 5 / 178606 7 / 85464 39 / 216846 25 / 960632 5 / 178606
muscle 3 / 24130 -- 13 / 137075 -- 3 / 24130 -- 13 / 137075 --
nervous 4 / 35780 -- -- -- 4 / 35780 -- -- --
ovary 3 / 43149 -- 23 / 354066 -- 3 / 43149 -- 23 / 354066 --
pancreas 4 / 75220   82 / 1338446 -- 4 / 75220 0 / 34 82 / 1338446 --
pancreatic islet 3 / 30771 -- -- -- 3 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 -- 7 / 145854 -- 1 / 17986 -- 7 / 145854 --
placenta   -- 4 / 292212 -- 0 / 37653 -- 4 / 292212 --
pooled tissue 6 / 99675 -- -- -- 6 / 99675 -- -- --
prostate     30 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 30 / 386047 --
retina 3 / 82470 -- 1 / 636203 -- 3 / 82470 -- 1 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 9 / 85891 3 / 31511 38 / 615945   9 / 85891 3 / 31511 38 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 28 / 73492 1 / 17831 17 / 386635 -- 28 / 73492 1 / 17831 17 / 386635 --
stem cell -- -- 7 / 234473 -- -- -- 7 / 234473 --
stomach 12 / 21241 -- 20 / 218318 -- 12 / 21241 -- 20 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 7 / 116987 1 / 2634 53 / 736319 -- 7 / 116987 1 / 2634 53 / 736319 --
thymus 18 / 100203 1 / 20273 33 / 346181 -- 18 / 100203 1 / 20273 33 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 21 / 262740 4 / 14058   -- 21 / 262740 4 / 14058 0 / 25954 --
uterus 2 / 6854 -- 13 / 206823 -- 2 / 6854 -- 13 / 206823 --
vascular 5 / 12366 -- 106 / 1092595 -- 5 / 12366 -- 106 / 1092595 --
white blood cells -- -- 26 / 398838 -- -- -- 26 / 398838 --
whole body -- -- 12 / 531904 3 / 212613 -- -- 12 / 531904 3 / 212613