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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.200916Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 2501 / 3259021 41 / 403641 19433 / 25718729 88 / 491920 2501 / 3259021 41 / 403641 19433 / 25718729 88 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 14 / 38915 -- 15 / 64924 -- 14 / 38915 -- 15 / 64924 --
bone marrow   -- 4 / 103390 -- 0 / 100926 -- 4 / 103390 --
brain 4 / 261599   145 / 7554651 -- 4 / 261599 0 / 2128 145 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 --     1 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 9 / 228104 -- -- -- 9 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 28 / 51804   -- -- 28 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 168 / 718928 12 / 9837 285 / 2760977 -- 168 / 718928 12 / 9837 285 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 16 / 211918 -- -- -- 16 / 211918 --
eye 2 / 94929 -- 3 / 138066 -- 2 / 94929 -- 3 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 78 / 548222 -- 1 / 34979 -- 78 / 548222 --
heart 25 / 49793 -- 922 / 1231698 -- 25 / 49793 -- 922 / 1231698 --
kidney 1830 / 121184   14848 / 1415985 -- 1830 / 121184 0 / 2215 14848 / 1415985 --
limb 16 / 16187 -- 28 / 595880 -- 16 / 16187 -- 28 / 595880 --
liver 21 / 104633   45 / 527425 -- 21 / 104633 0 / 6685 45 / 527425 --
lung 28 / 26861 7 / 72516 325 / 943009 -- 28 / 26861 7 / 72516 325 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 35 / 344354 -- 1 / 14648 -- 35 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 14 / 85464 17 / 216846 1051 / 960632 81 / 178606 14 / 85464 17 / 216846 1051 / 960632 81 / 178606
muscle 8 / 24130 -- 1 / 137075 -- 8 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 -- 23 / 354066 -- 1 / 43149 -- 23 / 354066 --
pancreas 2 / 75220   401 / 1338446 -- 2 / 75220 0 / 34 401 / 1338446 --
pancreatic islet 12 / 30771 -- -- -- 12 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 1 / 9981 -- -- -- 1 / 9981 -- -- --
pineal gland 21 / 3907 -- -- -- 21 / 3907 -- -- --
pituitary gland 4 / 17986 -- 24 / 145854 -- 4 / 17986 -- 24 / 145854 --
placenta 83 / 37653 -- 211 / 292212 -- 83 / 37653 -- 211 / 292212 --
pooled tissue 38 / 99675 -- -- -- 38 / 99675 -- -- --
prostate     173 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 173 / 386047 --
retina   -- 6 / 636203 -- 0 / 82470 -- 6 / 636203 --
salivary gland 3 / 18434   -- -- 3 / 18434 0 / 958 -- --
skin 11 / 85891 4 / 31511 424 / 615945 7 / 57574 11 / 85891 4 / 31511 424 / 615945 7 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 10 / 73492   20 / 386635 -- 10 / 73492 0 / 17831 20 / 386635 --
stem cell -- -- 11 / 234473 -- -- -- 11 / 234473 --
stomach   -- 9 / 218318 -- 0 / 21241 -- 9 / 218318 --
synovium 10 / 16875 -- -- -- 10 / 16875 -- -- --
testis 7 / 116987   42 / 736319 -- 7 / 116987 0 / 2634 42 / 736319 --
thymus 5 / 100203   9 / 346181 -- 5 / 100203 0 / 20273 9 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 112 / 262740 1 / 14058   -- 112 / 262740 1 / 14058 0 / 25954 --
uterus 9 / 6854 -- 14 / 206823 -- 9 / 6854 -- 14 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 103 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 103 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 162 / 531904   -- -- 162 / 531904 0 / 212613