Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.200383Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 251 / 3259021 49 / 403641 381 / 25718729 5 / 491920 251 / 3259021 49 / 403641 381 / 25718729 5 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 6 / 38915 --   -- 6 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 6 / 100926 -- 1 / 103390 -- 6 / 100926 -- 1 / 103390 --
brain 17 / 261599 1 / 2128 129 / 7554651 -- 17 / 261599 1 / 2128 129 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 10 / 56549 -- 3 / 233710   10 / 56549 -- 3 / 233710 0 / 43127
cerebrum 31 / 228104 -- -- -- 31 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 10 / 39315 -- -- -- 10 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 43 / 718928 1 / 9837 49 / 2760977 -- 43 / 718928 1 / 9837 49 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 4 / 94929 -- 1 / 138066 -- 4 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 14 / 548222 -- 0 / 34979 -- 14 / 548222 --
heart 6 / 49793 -- 24 / 1231698 -- 6 / 49793 -- 24 / 1231698 --
kidney 6 / 121184 1 / 2215 21 / 1415985 -- 6 / 121184 1 / 2215 21 / 1415985 --
limb 4 / 16187 -- 13 / 595880 -- 4 / 16187 -- 13 / 595880 --
liver 4 / 104633 1 / 6685 12 / 527425 -- 4 / 104633 1 / 6685 12 / 527425 --
lung 4 / 26861 8 / 72516 13 / 943009 -- 4 / 26861 8 / 72516 13 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 5 / 344354 -- 1 / 14648 -- 5 / 344354 --
lymphoreticular 3 / 3137   -- -- 3 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 3 / 85464 28 / 216846 9 / 960632 3 / 178606 3 / 85464 28 / 216846 9 / 960632 3 / 178606
muscle 2 / 24130 --   -- 2 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary   -- 6 / 354066 -- 0 / 43149 -- 6 / 354066 --
pancreas     21 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 21 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 -- 2 / 145854 -- 1 / 17986 -- 2 / 145854 --
placenta 1 / 37653 --   -- 1 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 16 / 99675 -- -- -- 16 / 99675 -- -- --
prostate     5 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 5 / 386047 --
retina 11 / 82470 -- 6 / 636203 -- 11 / 82470 -- 6 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 5 / 85891 5 / 31511 7 / 615945 1 / 57574 5 / 85891 5 / 31511 7 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 14 / 73492   2 / 386635 -- 14 / 73492 0 / 17831 2 / 386635 --
stem cell -- -- 2 / 234473 -- -- -- 2 / 234473 --
stomach   -- 8 / 218318 -- 0 / 21241 -- 8 / 218318 --
synovium 6 / 16875 -- -- -- 6 / 16875 -- -- --
testis 4 / 116987   4 / 736319 -- 4 / 116987 0 / 2634 4 / 736319 --
thymus 11 / 100203 2 / 20273 6 / 346181 -- 11 / 100203 2 / 20273 6 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 19 / 262740 2 / 14058 2 / 25954 -- 19 / 262740 2 / 14058 2 / 25954 --
uterus   -- 2 / 206823 -- 0 / 6854 -- 2 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 8 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 8 / 1092595 --
white blood cells -- -- 4 / 398838 -- -- -- 4 / 398838 --
whole body -- -- 2 / 531904 1 / 212613 -- -- 2 / 531904 1 / 212613