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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.1956Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 238 / 3259021   270 / 25718729   238 / 3259021 0 / 403641 270 / 25718729 0 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 64 / 261599   222 / 7554651 -- 64 / 261599 0 / 2128 222 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 3 / 56549 --     3 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 31 / 228104 -- -- -- 31 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 39 / 718928   32 / 2760977 -- 39 / 718928 0 / 9837 32 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 3 / 211918 -- -- -- 3 / 211918 --
eye 4 / 94929 --   -- 4 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   --   -- 0 / 34979 -- 0 / 548222 --
heart   --   -- 0 / 49793 -- 0 / 1231698 --
kidney       -- 0 / 121184 0 / 2215 0 / 1415985 --
limb   --   -- 0 / 16187 -- 0 / 595880 --
liver       -- 0 / 104633 0 / 6685 0 / 527425 --
lung     1 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 1 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland         0 / 85464 0 / 216846 0 / 960632 0 / 178606
muscle 1 / 24130 --   -- 1 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 27 / 35780 -- -- -- 27 / 35780 -- -- --
ovary   --   -- 0 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas 8 / 75220     -- 8 / 75220 0 / 34 0 / 1338446 --
pancreatic islet 2 / 30771 -- -- -- 2 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 13 / 9981 -- -- -- 13 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   -- 1 / 292212 -- 0 / 37653 -- 1 / 292212 --
pooled tissue 7 / 99675 -- -- -- 7 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   1 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 1 / 386047 --
retina 34 / 82470 -- 3 / 636203 -- 34 / 82470 -- 3 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     1 / 615945   0 / 85891 0 / 31511 1 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 1 / 73492     -- 1 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   -- 1 / 218318 -- 0 / 21241 -- 1 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis       -- 0 / 116987 0 / 2634 0 / 736319 --
thymus       -- 0 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 2 / 262740     -- 2 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   --   -- 0 / 12366 -- 0 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 5 / 531904   -- -- 5 / 531904 0 / 212613