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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.1856Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 28 / 3259021   428 / 25718729 1 / 491920 28 / 3259021 0 / 403641 428 / 25718729 1 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 4 / 38915 -- 1 / 64924 -- 4 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow 1 / 100926 -- 15 / 103390 -- 1 / 100926 -- 15 / 103390 --
brain     2 / 7554651 -- 0 / 261599 0 / 2128 2 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 3 / 233710   0 / 56549 -- 3 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 4 / 718928   6 / 2760977 -- 4 / 718928 0 / 9837 6 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye   --   -- 0 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 1 / 548222 -- 0 / 34979 -- 1 / 548222 --
heart   --   -- 0 / 49793 -- 0 / 1231698 --
kidney     1 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 1 / 1415985 --
limb 2 / 16187 --   -- 2 / 16187 -- 0 / 595880 --
liver     12 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 12 / 527425 --
lung 1 / 26861   2 / 943009 -- 1 / 26861 0 / 72516 2 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 -- 313 / 344354 -- 2 / 14648 -- 313 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland     2 / 960632 1 / 178606 0 / 85464 0 / 216846 2 / 960632 1 / 178606
muscle   -- 1 / 137075 -- 0 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   --   -- 0 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas 1 / 75220   2 / 1338446 -- 1 / 75220 0 / 34 2 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 1 / 99675 -- -- -- 1 / 99675 -- -- --
prostate       -- 0 / 23701 0 / 5 0 / 386047 --
retina   --   -- 0 / 82470 -- 0 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin         0 / 85891 0 / 31511 0 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 8 / 73492   10 / 386635 -- 8 / 73492 0 / 17831 10 / 386635 --
stem cell -- -- 11 / 234473 -- -- -- 11 / 234473 --
stomach 1 / 21241 --   -- 1 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis       -- 0 / 116987 0 / 2634 0 / 736319 --
thymus       -- 0 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 1 / 262740     -- 1 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular 2 / 12366 -- 39 / 1092595 -- 2 / 12366 -- 39 / 1092595 --
white blood cells -- -- 1 / 398838 -- -- -- 1 / 398838 --
whole body -- -- 5 / 531904   -- -- 5 / 531904 0 / 212613