Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.1843Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 864 / 3259021 58 / 403641 14 / 25718729   864 / 3259021 58 / 403641 14 / 25718729 0 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 1 / 38915 --   -- 1 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 18 / 100926 --   -- 18 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 64 / 261599   4 / 7554651 -- 64 / 261599 0 / 2128 4 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 2 / 56549 --     2 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 30 / 228104 -- -- -- 30 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 4 / 51804   -- -- 4 / 51804 0 / 689 -- --
ear 10 / 39315 -- -- -- 10 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 349 / 718928 1 / 9837 1 / 2760977 -- 349 / 718928 1 / 9837 1 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 52 / 94929 --   -- 52 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract 4 / 34979 --   -- 4 / 34979 -- 0 / 548222 --
heart 8 / 49793 -- 1 / 1231698 -- 8 / 49793 -- 1 / 1231698 --
kidney 17 / 121184     -- 17 / 121184 0 / 2215 0 / 1415985 --
limb 1 / 16187 --   -- 1 / 16187 -- 0 / 595880 --
liver 4 / 104633     -- 4 / 104633 0 / 6685 0 / 527425 --
lung 1 / 26861 3 / 72516   -- 1 / 26861 3 / 72516 0 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 --   -- 1 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 3 / 85464 24 / 216846 2 / 960632   3 / 85464 24 / 216846 2 / 960632 0 / 178606
muscle 5 / 24130 --   -- 5 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 4 / 35780 -- -- -- 4 / 35780 -- -- --
ovary 32 / 43149 --   -- 32 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas 5 / 75220   1 / 1338446 -- 5 / 75220 0 / 34 1 / 1338446 --
pancreatic islet 3 / 30771 -- -- -- 3 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 3 / 9981 -- -- -- 3 / 9981 -- -- --
pineal gland 2 / 3907 -- -- -- 2 / 3907 -- -- --
pituitary gland 3 / 17986 --   -- 3 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta 3 / 37653 --   -- 3 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 9 / 99675 -- -- -- 9 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701     -- 1 / 23701 0 / 5 0 / 386047 --
retina 41 / 82470 -- 2 / 636203 -- 41 / 82470 -- 2 / 636203 --
salivary gland 3 / 18434   -- -- 3 / 18434 0 / 958 -- --
skin 4 / 85891 3 / 31511     4 / 85891 3 / 31511 0 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 2 / 73492 8 / 17831   -- 2 / 73492 8 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- -- 1 / 234473 -- -- -- 1 / 234473 --
stomach 2 / 21241 --   -- 2 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 30 / 116987 9 / 2634   -- 30 / 116987 9 / 2634 0 / 736319 --
thymus 3 / 100203 8 / 20273   -- 3 / 100203 8 / 20273 0 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 137 / 262740 2 / 14058   -- 137 / 262740 2 / 14058 0 / 25954 --
uterus 1 / 6854 --   -- 1 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 1 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 1 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 1 / 531904   -- -- 1 / 531904 0 / 212613