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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.183003Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 126 / 3259021 36 / 403641 24 / 25718729   126 / 3259021 36 / 403641 24 / 25718729 0 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain     1 / 7554651 -- 0 / 261599 0 / 2128 1 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   --     0 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 6 / 51804   -- -- 6 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 41 / 718928   3 / 2760977 -- 41 / 718928 0 / 9837 3 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 1 / 94929 --   -- 1 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 2 / 548222 -- 0 / 34979 -- 2 / 548222 --
heart   --   -- 0 / 49793 -- 0 / 1231698 --
kidney 19 / 121184   4 / 1415985 -- 19 / 121184 0 / 2215 4 / 1415985 --
limb   --   -- 0 / 16187 -- 0 / 595880 --
liver 9 / 104633   3 / 527425 -- 9 / 104633 0 / 6685 3 / 527425 --
lung 4 / 26861 7 / 72516   -- 4 / 26861 7 / 72516 0 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 6 / 85464 29 / 216846 1 / 960632   6 / 85464 29 / 216846 1 / 960632 0 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   --   -- 0 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas 2 / 75220   2 / 1338446 -- 2 / 75220 0 / 34 2 / 1338446 --
pancreatic islet 1 / 30771 -- -- -- 1 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 --   -- 1 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 3 / 99675 -- -- -- 3 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701     -- 1 / 23701 0 / 5 0 / 386047 --
retina   --   -- 0 / 82470 -- 0 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 10 / 85891   4 / 615945   10 / 85891 0 / 31511 4 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen       -- 0 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   -- 1 / 218318 -- 0 / 21241 -- 1 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     2 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 2 / 736319 --
thymus 7 / 100203     -- 7 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 15 / 262740     -- 15 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   --   -- 0 / 12366 -- 0 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- --     -- -- 0 / 531904 0 / 212613