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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.178Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 621 / 3259021 15 / 403641 2160 / 25718729 5 / 491920 621 / 3259021 15 / 403641 2160 / 25718729 5 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 2 / 64924 -- 0 / 38915 -- 2 / 64924 --
bone marrow   -- 1 / 103390 -- 0 / 100926 -- 1 / 103390 --
brain 24 / 261599 1 / 2128 924 / 7554651 -- 24 / 261599 1 / 2128 924 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 4 / 56549 -- 1 / 233710 2 / 43127 4 / 56549 -- 1 / 233710 2 / 43127
cerebrum 21 / 228104 -- -- -- 21 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 4 / 51804   -- -- 4 / 51804 0 / 689 -- --
ear 3 / 39315 -- -- -- 3 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 168 / 718928 2 / 9837 45 / 2760977 -- 168 / 718928 2 / 9837 45 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 201 / 94929 --   -- 201 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 1 / 548222 -- 1 / 34979 -- 1 / 548222 --
heart 30 / 49793 -- 481 / 1231698 -- 30 / 49793 -- 481 / 1231698 --
kidney 33 / 121184   69 / 1415985 -- 33 / 121184 0 / 2215 69 / 1415985 --
limb 3 / 16187 -- 13 / 595880 -- 3 / 16187 -- 13 / 595880 --
liver 1 / 104633   4 / 527425 -- 1 / 104633 0 / 6685 4 / 527425 --
lung 3 / 26861 1 / 72516 66 / 943009 -- 3 / 26861 1 / 72516 66 / 943009 --
lymph node   -- 4 / 344354 -- 0 / 14648 -- 4 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 6 / 85464 10 / 216846 54 / 960632   6 / 85464 10 / 216846 54 / 960632 0 / 178606
muscle 13 / 24130 -- 64 / 137075 -- 13 / 24130 -- 64 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 -- 9 / 354066 -- 1 / 43149 -- 9 / 354066 --
pancreas 10 / 75220   58 / 1338446 -- 10 / 75220 0 / 34 58 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland 3 / 3907 -- -- -- 3 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta 24 / 37653 -- 133 / 292212 -- 24 / 37653 -- 133 / 292212 --
pooled tissue 17 / 99675 -- -- -- 17 / 99675 -- -- --
prostate 2 / 23701   9 / 386047 -- 2 / 23701 0 / 5 9 / 386047 --
retina 2 / 82470 -- 14 / 636203 -- 2 / 82470 -- 14 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 6 / 85891 1 / 31511 82 / 615945 2 / 57574 6 / 85891 1 / 31511 82 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     10 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 10 / 386635 --
stem cell -- -- 4 / 234473 -- -- -- 4 / 234473 --
stomach 2 / 21241 -- 2 / 218318 -- 2 / 21241 -- 2 / 218318 --
synovium 2 / 16875 -- -- -- 2 / 16875 -- -- --
testis 10 / 116987   5 / 736319 -- 10 / 116987 0 / 2634 5 / 736319 --
thymus 1 / 100203   3 / 346181 -- 1 / 100203 0 / 20273 3 / 346181 --
thyroid 9 / 8821 -- -- -- 9 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 14 / 262740     -- 14 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus 2 / 6854 -- 2 / 206823 -- 2 / 6854 -- 2 / 206823 --
vascular   -- 67 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 67 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 31 / 531904 1 / 212613 -- -- 31 / 531904 1 / 212613