Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.17774Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 205 / 3259021 1 / 403641 2121 / 25718729 11 / 491920 205 / 3259021 1 / 403641 2121 / 25718729 11 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 -- 2 / 64924 -- 2 / 38915 -- 2 / 64924 --
bone marrow 30 / 100926 -- 1 / 103390 -- 30 / 100926 -- 1 / 103390 --
brain 9 / 261599   587 / 7554651 -- 9 / 261599 0 / 2128 587 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 20 / 233710 1 / 43127 0 / 56549 -- 20 / 233710 1 / 43127
cerebrum 1 / 228104 -- -- -- 1 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 125 / 718928   255 / 2760977 -- 125 / 718928 0 / 9837 255 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 14 / 211918 -- -- -- 14 / 211918 --
eye 4 / 94929 -- 11 / 138066 -- 4 / 94929 -- 11 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 37 / 548222 -- 0 / 34979 -- 37 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 98 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 98 / 1231698 --
kidney     116 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 116 / 1415985 --
limb   -- 55 / 595880 -- 0 / 16187 -- 55 / 595880 --
liver 2 / 104633   21 / 527425 -- 2 / 104633 0 / 6685 21 / 527425 --
lung 2 / 26861   83 / 943009 -- 2 / 26861 0 / 72516 83 / 943009 --
lymph node   -- 34 / 344354 -- 0 / 14648 -- 34 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland   1 / 216846 47 / 960632 5 / 178606 0 / 85464 1 / 216846 47 / 960632 5 / 178606
muscle   -- 8 / 137075 -- 0 / 24130 -- 8 / 137075 --
nervous 3 / 35780 -- -- -- 3 / 35780 -- -- --
ovary   -- 77 / 354066 -- 0 / 43149 -- 77 / 354066 --
pancreas 1 / 75220   89 / 1338446 -- 1 / 75220 0 / 34 89 / 1338446 --
pancreatic islet 1 / 30771 -- -- -- 1 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 6 / 145854 -- 0 / 17986 -- 6 / 145854 --
placenta   -- 13 / 292212 -- 0 / 37653 -- 13 / 292212 --
pooled tissue 5 / 99675 -- -- -- 5 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   25 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 25 / 386047 --
retina 1 / 82470 -- 53 / 636203 -- 1 / 82470 -- 53 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     44 / 615945 2 / 57574 0 / 85891 0 / 31511 44 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     36 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 36 / 386635 --
stem cell -- -- 17 / 234473 -- -- -- 17 / 234473 --
stomach   -- 33 / 218318 -- 0 / 21241 -- 33 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     100 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 100 / 736319 --
thymus 14 / 100203   30 / 346181 -- 14 / 100203 0 / 20273 30 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 3 / 262740     -- 3 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 48 / 206823 -- 0 / 6854 -- 48 / 206823 --
vascular   -- 118 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 118 / 1092595 --
white blood cells -- -- 9 / 398838 -- -- -- 9 / 398838 --
whole body -- -- 34 / 531904 3 / 212613 -- -- 34 / 531904 3 / 212613