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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.172346Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 341 / 3259021 59 / 403641 604 / 25718729 38 / 491920 341 / 3259021 59 / 403641 604 / 25718729 38 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 36 / 38915 -- 3 / 64924 -- 36 / 38915 -- 3 / 64924 --
bone marrow 13 / 100926 -- 9 / 103390 -- 13 / 100926 -- 9 / 103390 --
brain 5 / 261599   40 / 7554651 -- 5 / 261599 0 / 2128 40 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 6 / 56549 --     6 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 16 / 228104 -- -- -- 16 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 9 / 51804   -- -- 9 / 51804 0 / 689 -- --
ear 6 / 39315 -- -- -- 6 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 42 / 718928   32 / 2760977 -- 42 / 718928 0 / 9837 32 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 2 / 211918 -- -- -- 2 / 211918 --
eye 16 / 94929 -- 1 / 138066 -- 16 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract 5 / 34979 -- 11 / 548222 -- 5 / 34979 -- 11 / 548222 --
heart 7 / 49793 -- 16 / 1231698 -- 7 / 49793 -- 16 / 1231698 --
kidney 16 / 121184   34 / 1415985 -- 16 / 121184 0 / 2215 34 / 1415985 --
limb 11 / 16187 -- 9 / 595880 -- 11 / 16187 -- 9 / 595880 --
liver 3 / 104633 3 / 6685 6 / 527425 -- 3 / 104633 3 / 6685 6 / 527425 --
lung 2 / 26861 6 / 72516 71 / 943009 -- 2 / 26861 6 / 72516 71 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 -- 16 / 344354 -- 2 / 14648 -- 16 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 20 / 85464 29 / 216846 62 / 960632 36 / 178606 20 / 85464 29 / 216846 62 / 960632 36 / 178606
muscle 6 / 24130 -- 7 / 137075 -- 6 / 24130 -- 7 / 137075 --
nervous 2 / 35780 -- -- -- 2 / 35780 -- -- --
ovary 3 / 43149 -- 11 / 354066 -- 3 / 43149 -- 11 / 354066 --
pancreas 3 / 75220   30 / 1338446 -- 3 / 75220 0 / 34 30 / 1338446 --
pancreatic islet 2 / 30771 -- -- -- 2 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland 2 / 3907 -- -- -- 2 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 --   -- 1 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta 1 / 37653 -- 4 / 292212 -- 1 / 37653 -- 4 / 292212 --
pooled tissue 11 / 99675 -- -- -- 11 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   15 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 15 / 386047 --
retina 1 / 82470 -- 1 / 636203 -- 1 / 82470 -- 1 / 636203 --
salivary gland 4 / 18434   -- -- 4 / 18434 0 / 958 -- --
skin 11 / 85891 20 / 31511 31 / 615945 1 / 57574 11 / 85891 20 / 31511 31 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 10 / 73492   44 / 386635 -- 10 / 73492 0 / 17831 44 / 386635 --
stem cell -- -- 4 / 234473 -- -- -- 4 / 234473 --
stomach   -- 5 / 218318 -- 0 / 21241 -- 5 / 218318 --
synovium 4 / 16875 -- -- -- 4 / 16875 -- -- --
testis 2 / 116987   15 / 736319 -- 2 / 116987 0 / 2634 15 / 736319 --
thymus 20 / 100203   9 / 346181 -- 20 / 100203 0 / 20273 9 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 37 / 262740 1 / 14058 2 / 25954 -- 37 / 262740 1 / 14058 2 / 25954 --
uterus 2 / 6854 -- 20 / 206823 -- 2 / 6854 -- 20 / 206823 --
vascular 2 / 12366 -- 49 / 1092595 -- 2 / 12366 -- 49 / 1092595 --
white blood cells -- -- 37 / 398838 -- -- -- 37 / 398838 --
whole body -- -- 8 / 531904 1 / 212613 -- -- 8 / 531904 1 / 212613