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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.17Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 317 / 3259021 55 / 403641 1352 / 25718729 10 / 491920 317 / 3259021 55 / 403641 1352 / 25718729 10 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 1 / 38915 -- 4 / 64924 -- 1 / 38915 -- 4 / 64924 --
bone marrow 3 / 100926 -- 7 / 103390 -- 3 / 100926 -- 7 / 103390 --
brain 6 / 261599   359 / 7554651 -- 6 / 261599 0 / 2128 359 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 2 / 56549 -- 4 / 233710   2 / 56549 -- 4 / 233710 0 / 43127
cerebrum 20 / 228104 -- -- -- 20 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 5 / 51804   -- -- 5 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 60 / 718928   136 / 2760977 -- 60 / 718928 0 / 9837 136 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 5 / 211918 -- -- -- 5 / 211918 --
eye 3 / 94929 -- 11 / 138066 -- 3 / 94929 -- 11 / 138066 --
gastrointestinal tract 10 / 34979 -- 20 / 548222 -- 10 / 34979 -- 20 / 548222 --
heart 2 / 49793 -- 55 / 1231698 -- 2 / 49793 -- 55 / 1231698 --
kidney 16 / 121184   151 / 1415985 -- 16 / 121184 0 / 2215 151 / 1415985 --
limb 1 / 16187 -- 17 / 595880 -- 1 / 16187 -- 17 / 595880 --
liver 16 / 104633 1 / 6685 20 / 527425 -- 16 / 104633 1 / 6685 20 / 527425 --
lung   6 / 72516 60 / 943009 -- 0 / 26861 6 / 72516 60 / 943009 --
lymph node   -- 20 / 344354 -- 0 / 14648 -- 20 / 344354 --
lymphoreticular   1 / 5421 -- -- 0 / 3137 1 / 5421 -- --
mammary gland 12 / 85464 22 / 216846 83 / 960632 5 / 178606 12 / 85464 22 / 216846 83 / 960632 5 / 178606
muscle 5 / 24130 -- 12 / 137075 -- 5 / 24130 -- 12 / 137075 --
nervous 2 / 35780 -- -- -- 2 / 35780 -- -- --
ovary 2 / 43149 -- 33 / 354066 -- 2 / 43149 -- 33 / 354066 --
pancreas 22 / 75220   50 / 1338446 -- 22 / 75220 0 / 34 50 / 1338446 --
pancreatic islet 1 / 30771 -- -- -- 1 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland 3 / 3907 -- -- -- 3 / 3907 -- -- --
pituitary gland 5 / 17986 -- 5 / 145854 -- 5 / 17986 -- 5 / 145854 --
placenta 10 / 37653 -- 26 / 292212 -- 10 / 37653 -- 26 / 292212 --
pooled tissue 8 / 99675 -- -- -- 8 / 99675 -- -- --
prostate 10 / 23701   17 / 386047 -- 10 / 23701 0 / 5 17 / 386047 --
retina 6 / 82470 -- 12 / 636203 -- 6 / 82470 -- 12 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434   -- -- 1 / 18434 0 / 958 -- --
skin 2 / 85891   27 / 615945 2 / 57574 2 / 85891 0 / 31511 27 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 2 / 73492 14 / 17831 19 / 386635 -- 2 / 73492 14 / 17831 19 / 386635 --
stem cell -- -- 8 / 234473 -- -- -- 8 / 234473 --
stomach 1 / 21241 -- 17 / 218318 -- 1 / 21241 -- 17 / 218318 --
synovium 7 / 16875 -- -- -- 7 / 16875 -- -- --
testis 18 / 116987   23 / 736319 -- 18 / 116987 0 / 2634 23 / 736319 --
thymus 9 / 100203 10 / 20273 21 / 346181 -- 9 / 100203 10 / 20273 21 / 346181 --
thyroid 5 / 8821 -- -- -- 5 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 40 / 262740 1 / 14058 1 / 25954 -- 40 / 262740 1 / 14058 1 / 25954 --
uterus   -- 28 / 206823 -- 0 / 6854 -- 28 / 206823 --
vascular   -- 24 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 24 / 1092595 --
white blood cells -- -- 22 / 398838 -- -- -- 22 / 398838 --
whole body -- -- 55 / 531904 3 / 212613 -- -- 55 / 531904 3 / 212613