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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.16716Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 636 / 3259021 112 / 403641 2440 / 25718729 102 / 491920 636 / 3259021 112 / 403641 2440 / 25718729 102 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 32 / 38915 -- 5 / 64924 -- 32 / 38915 -- 5 / 64924 --
bone marrow 32 / 100926 -- 52 / 103390 -- 32 / 100926 -- 52 / 103390 --
brain 33 / 261599   548 / 7554651 -- 33 / 261599 0 / 2128 548 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 4 / 56549 -- 26 / 233710   4 / 56549 -- 26 / 233710 0 / 43127
cerebrum 23 / 228104 -- -- -- 23 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 12 / 51804   -- -- 12 / 51804 0 / 689 -- --
ear 7 / 39315 -- -- -- 7 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 118 / 718928 3 / 9837 242 / 2760977 -- 118 / 718928 3 / 9837 242 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 6 / 211918 -- -- -- 6 / 211918 --
eye 31 / 94929 -- 9 / 138066 -- 31 / 94929 -- 9 / 138066 --
gastrointestinal tract 7 / 34979 -- 46 / 548222 -- 7 / 34979 -- 46 / 548222 --
heart 13 / 49793 -- 111 / 1231698 -- 13 / 49793 -- 111 / 1231698 --
kidney 42 / 121184   248 / 1415985 -- 42 / 121184 0 / 2215 248 / 1415985 --
limb   -- 38 / 595880 -- 0 / 16187 -- 38 / 595880 --
liver 33 / 104633   77 / 527425 -- 33 / 104633 0 / 6685 77 / 527425 --
lung 6 / 26861 16 / 72516 103 / 943009 -- 6 / 26861 16 / 72516 103 / 943009 --
lymph node 5 / 14648 -- 30 / 344354 -- 5 / 14648 -- 30 / 344354 --
lymphoreticular   1 / 5421 -- -- 0 / 3137 1 / 5421 -- --
mammary gland 30 / 85464 67 / 216846 146 / 960632 61 / 178606 30 / 85464 67 / 216846 146 / 960632 61 / 178606
muscle 15 / 24130 -- 8 / 137075 -- 15 / 24130 -- 8 / 137075 --
nervous 6 / 35780 -- -- -- 6 / 35780 -- -- --
ovary 30 / 43149 -- 14 / 354066 -- 30 / 43149 -- 14 / 354066 --
pancreas 16 / 75220   96 / 1338446 -- 16 / 75220 0 / 34 96 / 1338446 --
pancreatic islet 9 / 30771 -- -- -- 9 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland 1 / 3907 -- -- -- 1 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 7 / 145854 -- 0 / 17986 -- 7 / 145854 --
placenta 18 / 37653 -- 29 / 292212 -- 18 / 37653 -- 29 / 292212 --
pooled tissue 8 / 99675 -- -- -- 8 / 99675 -- -- --
prostate     78 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 78 / 386047 --
retina 10 / 82470 -- 30 / 636203 -- 10 / 82470 -- 30 / 636203 --
salivary gland 3 / 18434   -- -- 3 / 18434 0 / 958 -- --
skin 7 / 85891 7 / 31511 50 / 615945 13 / 57574 7 / 85891 7 / 31511 50 / 615945 13 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 9 / 73492 1 / 17831 24 / 386635 -- 9 / 73492 1 / 17831 24 / 386635 --
stem cell -- -- 28 / 234473 -- -- -- 28 / 234473 --
stomach 3 / 21241 -- 16 / 218318 -- 3 / 21241 -- 16 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 20 / 116987 2 / 2634 36 / 736319 -- 20 / 116987 2 / 2634 36 / 736319 --
thymus 13 / 100203 4 / 20273 14 / 346181 -- 13 / 100203 4 / 20273 14 / 346181 --
thyroid 4 / 8821 -- -- -- 4 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 34 / 262740 11 / 14058 1 / 25954 -- 34 / 262740 11 / 14058 1 / 25954 --
uterus 2 / 6854 -- 9 / 206823 -- 2 / 6854 -- 9 / 206823 --
vascular   -- 269 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 269 / 1092595 --
white blood cells -- -- 14 / 398838 -- -- -- 14 / 398838 --
whole body -- -- 30 / 531904 28 / 212613 -- -- 30 / 531904 28 / 212613