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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.162811Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 418 / 3259021 69 / 403641 1197 / 25718729 15 / 491920 418 / 3259021 69 / 403641 1197 / 25718729 15 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 1 / 38915 -- 4 / 64924 -- 1 / 38915 -- 4 / 64924 --
bone marrow 23 / 100926 -- 16 / 103390 -- 23 / 100926 -- 16 / 103390 --
brain 21 / 261599   431 / 7554651 -- 21 / 261599 0 / 2128 431 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 4 / 56549 -- 11 / 233710   4 / 56549 -- 11 / 233710 0 / 43127
cerebrum 38 / 228104 -- -- -- 38 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 8 / 51804   -- -- 8 / 51804 0 / 689 -- --
ear 9 / 39315 -- -- -- 9 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 89 / 718928 1 / 9837 118 / 2760977 -- 89 / 718928 1 / 9837 118 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 6 / 211918 -- -- -- 6 / 211918 --
eye 14 / 94929 -- 6 / 138066 -- 14 / 94929 -- 6 / 138066 --
gastrointestinal tract 6 / 34979 -- 32 / 548222 -- 6 / 34979 -- 32 / 548222 --
heart 11 / 49793 -- 43 / 1231698 -- 11 / 49793 -- 43 / 1231698 --
kidney 13 / 121184 1 / 2215 43 / 1415985 -- 13 / 121184 1 / 2215 43 / 1415985 --
limb 2 / 16187 -- 36 / 595880 -- 2 / 16187 -- 36 / 595880 --
liver 14 / 104633 1 / 6685 9 / 527425 -- 14 / 104633 1 / 6685 9 / 527425 --
lung 7 / 26861 9 / 72516 50 / 943009 -- 7 / 26861 9 / 72516 50 / 943009 --
lymph node   -- 22 / 344354 -- 0 / 14648 -- 22 / 344354 --
lymphoreticular 5 / 3137 1 / 5421 -- -- 5 / 3137 1 / 5421 -- --
mammary gland 14 / 85464 40 / 216846 18 / 960632 2 / 178606 14 / 85464 40 / 216846 18 / 960632 2 / 178606
muscle   -- 1 / 137075 -- 0 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous 2 / 35780 -- -- -- 2 / 35780 -- -- --
ovary 4 / 43149 -- 9 / 354066 -- 4 / 43149 -- 9 / 354066 --
pancreas 16 / 75220   70 / 1338446 -- 16 / 75220 0 / 34 70 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 2 / 9981 -- -- -- 2 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 4 / 17986 -- 3 / 145854 -- 4 / 17986 -- 3 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 7 / 292212 -- 2 / 37653 -- 7 / 292212 --
pooled tissue 18 / 99675 -- -- -- 18 / 99675 -- -- --
prostate     15 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 15 / 386047 --
retina 8 / 82470 -- 9 / 636203 -- 8 / 82470 -- 9 / 636203 --
salivary gland 3 / 18434   -- -- 3 / 18434 0 / 958 -- --
skin 3 / 85891 1 / 31511 18 / 615945 2 / 57574 3 / 85891 1 / 31511 18 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 11 / 73492 1 / 17831 10 / 386635 -- 11 / 73492 1 / 17831 10 / 386635 --
stem cell -- -- 16 / 234473 -- -- -- 16 / 234473 --
stomach 5 / 21241 -- 11 / 218318 -- 5 / 21241 -- 11 / 218318 --
synovium 5 / 16875 -- -- -- 5 / 16875 -- -- --
testis 3 / 116987   4 / 736319 -- 3 / 116987 0 / 2634 4 / 736319 --
thymus 23 / 100203 9 / 20273 12 / 346181 -- 23 / 100203 9 / 20273 12 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 30 / 262740 5 / 14058 2 / 25954 -- 30 / 262740 5 / 14058 2 / 25954 --
uterus   -- 3 / 206823 -- 0 / 6854 -- 3 / 206823 --
vascular   -- 95 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 95 / 1092595 --
white blood cells -- -- 45 / 398838 -- -- -- 45 / 398838 --
whole body -- -- 22 / 531904 11 / 212613 -- -- 22 / 531904 11 / 212613