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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.1568Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 1285 / 3259021 274 / 403641 1758 / 25718729 42 / 491920 1285 / 3259021 274 / 403641 1758 / 25718729 42 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 151 / 38915 -- 7 / 64924 -- 151 / 38915 -- 7 / 64924 --
bone marrow 413 / 100926 -- 71 / 103390 -- 413 / 100926 -- 71 / 103390 --
brain 18 / 261599 5 / 2128 275 / 7554651 -- 18 / 261599 5 / 2128 275 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 2 / 56549 -- 44 / 233710   2 / 56549 -- 44 / 233710 0 / 43127
cerebrum 74 / 228104 -- -- -- 74 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 27 / 51804   -- -- 27 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 209 / 718928 4 / 9837 152 / 2760977 -- 209 / 718928 4 / 9837 152 / 2760977 --
endocrine 2 / 2473 -- -- -- 2 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 3 / 211918 -- -- -- 3 / 211918 --
eye 8 / 94929 -- 3 / 138066 -- 8 / 94929 -- 3 / 138066 --
gastrointestinal tract 3 / 34979 -- 23 / 548222 -- 3 / 34979 -- 23 / 548222 --
heart 5 / 49793 -- 47 / 1231698 -- 5 / 49793 -- 47 / 1231698 --
kidney 30 / 121184 6 / 2215 62 / 1415985 -- 30 / 121184 6 / 2215 62 / 1415985 --
limb 34 / 16187 -- 28 / 595880 -- 34 / 16187 -- 28 / 595880 --
liver 44 / 104633 5 / 6685 23 / 527425 -- 44 / 104633 5 / 6685 23 / 527425 --
lung 7 / 26861 34 / 72516 54 / 943009 -- 7 / 26861 34 / 72516 54 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 31 / 344354 -- 1 / 14648 -- 31 / 344354 --
lymphoreticular 3 / 3137   -- -- 3 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 12 / 85464 183 / 216846 139 / 960632 19 / 178606 12 / 85464 183 / 216846 139 / 960632 19 / 178606
muscle 6 / 24130 -- 9 / 137075 -- 6 / 24130 -- 9 / 137075 --
nervous 4 / 35780 -- -- -- 4 / 35780 -- -- --
ovary 10 / 43149 -- 23 / 354066 -- 10 / 43149 -- 23 / 354066 --
pancreas 7 / 75220   61 / 1338446 -- 7 / 75220 0 / 34 61 / 1338446 --
pancreatic islet 5 / 30771 -- -- -- 5 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 3 / 17986 -- 8 / 145854 -- 3 / 17986 -- 8 / 145854 --
placenta 15 / 37653 -- 8 / 292212 -- 15 / 37653 -- 8 / 292212 --
pooled tissue 10 / 99675 -- -- -- 10 / 99675 -- -- --
prostate 4 / 23701   91 / 386047 -- 4 / 23701 0 / 5 91 / 386047 --
retina 1 / 82470 -- 26 / 636203 -- 1 / 82470 -- 26 / 636203 --
salivary gland 10 / 18434   -- -- 10 / 18434 0 / 958 -- --
skin 24 / 85891 10 / 31511 50 / 615945 5 / 57574 24 / 85891 10 / 31511 50 / 615945 5 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 14 / 73492   13 / 386635 -- 14 / 73492 0 / 17831 13 / 386635 --
stem cell -- -- 49 / 234473 -- -- -- 49 / 234473 --
stomach 1 / 21241 -- 9 / 218318 -- 1 / 21241 -- 9 / 218318 --
synovium 8 / 16875 -- -- -- 8 / 16875 -- -- --
testis 8 / 116987 3 / 2634 23 / 736319 -- 8 / 116987 3 / 2634 23 / 736319 --
thymus 5 / 100203   19 / 346181 -- 5 / 100203 0 / 20273 19 / 346181 --
thyroid 5 / 8821 -- -- -- 5 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 100 / 262740 24 / 14058 2 / 25954 -- 100 / 262740 24 / 14058 2 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 13 / 206823 -- 1 / 6854 -- 13 / 206823 --
vascular   -- 347 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 347 / 1092595 --
white blood cells -- -- 14 / 398838 -- -- -- 14 / 398838 --
whole body -- -- 31 / 531904 18 / 212613 -- -- 31 / 531904 18 / 212613