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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.1508Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 281 / 3259021 81 / 403641 2070 / 25718729 230 / 491920 281 / 3259021 81 / 403641 2070 / 25718729 230 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 3 / 38915 -- 12 / 64924 -- 3 / 38915 -- 12 / 64924 --
bone marrow 38 / 100926 -- 39 / 103390 -- 38 / 100926 -- 39 / 103390 --
brain 2 / 261599 2 / 2128 67 / 7554651 -- 2 / 261599 2 / 2128 67 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 2 / 56549 -- 16 / 233710 1 / 43127 2 / 56549 -- 16 / 233710 1 / 43127
cerebrum 2 / 228104 -- -- -- 2 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 14 / 51804 1 / 689 -- -- 14 / 51804 1 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 41 / 718928   131 / 2760977 -- 41 / 718928 0 / 9837 131 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 4 / 211918 -- -- -- 4 / 211918 --
eye 1 / 94929 --   -- 1 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract 5 / 34979 -- 20 / 548222 -- 5 / 34979 -- 20 / 548222 --
heart 4 / 49793 -- 95 / 1231698 -- 4 / 49793 -- 95 / 1231698 --
kidney 8 / 121184 2 / 2215 171 / 1415985 -- 8 / 121184 2 / 2215 171 / 1415985 --
limb 3 / 16187 -- 19 / 595880 -- 3 / 16187 -- 19 / 595880 --
liver 26 / 104633 1 / 6685 75 / 527425 -- 26 / 104633 1 / 6685 75 / 527425 --
lung 4 / 26861 18 / 72516 108 / 943009 -- 4 / 26861 18 / 72516 108 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 -- 68 / 344354 -- 2 / 14648 -- 68 / 344354 --
lymphoreticular 1 / 3137 1 / 5421 -- -- 1 / 3137 1 / 5421 -- --
mammary gland 25 / 85464 36 / 216846 572 / 960632 175 / 178606 25 / 85464 36 / 216846 572 / 960632 175 / 178606
muscle 8 / 24130 -- 8 / 137075 -- 8 / 24130 -- 8 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary   -- 24 / 354066 -- 0 / 43149 -- 24 / 354066 --
pancreas 5 / 75220   69 / 1338446 -- 5 / 75220 0 / 34 69 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland 1 / 3907 -- -- -- 1 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 -- 7 / 145854 -- 1 / 17986 -- 7 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 1 / 292212 -- 2 / 37653 -- 1 / 292212 --
pooled tissue 8 / 99675 -- -- -- 8 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   35 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 35 / 386047 --
retina 1 / 82470 -- 13 / 636203 -- 1 / 82470 -- 13 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434   -- -- 1 / 18434 0 / 958 -- --
skin 4 / 85891   92 / 615945 29 / 57574 4 / 85891 0 / 31511 92 / 615945 29 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 13 / 73492 7 / 17831 72 / 386635 -- 13 / 73492 7 / 17831 72 / 386635 --
stem cell -- -- 12 / 234473 -- -- -- 12 / 234473 --
stomach 9 / 21241 -- 9 / 218318 -- 9 / 21241 -- 9 / 218318 --
synovium 3 / 16875 -- -- -- 3 / 16875 -- -- --
testis 3 / 116987 2 / 2634 46 / 736319 -- 3 / 116987 2 / 2634 46 / 736319 --
thymus 6 / 100203 10 / 20273 33 / 346181 -- 6 / 100203 10 / 20273 33 / 346181 --
thyroid 7 / 8821 -- -- -- 7 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 20 / 262740 1 / 14058 3 / 25954 -- 20 / 262740 1 / 14058 3 / 25954 --
uterus   -- 22 / 206823 -- 0 / 6854 -- 22 / 206823 --
vascular   -- 136 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 136 / 1092595 --
white blood cells -- -- 47 / 398838 -- -- -- 47 / 398838 --
whole body -- -- 44 / 531904 25 / 212613 -- -- 44 / 531904 25 / 212613