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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.138471Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 6473 / 3259021 949 / 403641 83255 / 25718729 2018 / 491920 6473 / 3259021 949 / 403641 83255 / 25718729 2018 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 111 / 38915 -- 171 / 64924 -- 111 / 38915 -- 171 / 64924 --
bone marrow 991 / 100926 -- 652 / 103390 -- 991 / 100926 -- 652 / 103390 --
brain 153 / 261599 3 / 2128 24549 / 7554651 -- 153 / 261599 3 / 2128 24549 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 25 / 56549 -- 566 / 233710 18 / 43127 25 / 56549 -- 566 / 233710 18 / 43127
cerebrum 79 / 228104 -- -- -- 79 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 87 / 51804 4 / 689 -- -- 87 / 51804 4 / 689 -- --
ear 44 / 39315 -- -- -- 44 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 2374 / 718928 14 / 9837 11522 / 2760977 -- 2374 / 718928 14 / 9837 11522 / 2760977 --
endocrine 1 / 2473 -- -- -- 1 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 781 / 211918 -- -- -- 781 / 211918 --
eye 90 / 94929 -- 520 / 138066 -- 90 / 94929 -- 520 / 138066 --
gastrointestinal tract 31 / 34979 -- 2509 / 548222 -- 31 / 34979 -- 2509 / 548222 --
heart 71 / 49793 -- 5293 / 1231698 -- 71 / 49793 -- 5293 / 1231698 --
kidney 240 / 121184 1 / 2215 3318 / 1415985 -- 240 / 121184 1 / 2215 3318 / 1415985 --
limb   -- 2800 / 595880 -- 0 / 16187 -- 2800 / 595880 --
liver 118 / 104633 25 / 6685 1132 / 527425 -- 118 / 104633 25 / 6685 1132 / 527425 --
lung 33 / 26861 215 / 72516 3074 / 943009 -- 33 / 26861 215 / 72516 3074 / 943009 --
lymph node 15 / 14648 -- 1000 / 344354 -- 15 / 14648 -- 1000 / 344354 --
lymphoreticular 10 / 3137 2 / 5421 -- -- 10 / 3137 2 / 5421 -- --
mammary gland 45 / 85464 551 / 216846 2218 / 960632 344 / 178606 45 / 85464 551 / 216846 2218 / 960632 344 / 178606
muscle 31 / 24130 -- 326 / 137075 -- 31 / 24130 -- 326 / 137075 --
nervous 74 / 35780 -- -- -- 74 / 35780 -- -- --
ovary 323 / 43149 -- 1710 / 354066 -- 323 / 43149 -- 1710 / 354066 --
pancreas 203 / 75220   3981 / 1338446 -- 203 / 75220 0 / 34 3981 / 1338446 --
pancreatic islet 72 / 30771 -- -- -- 72 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 31 / 9981 -- -- -- 31 / 9981 -- -- --
pineal gland 14 / 3907 -- -- -- 14 / 3907 -- -- --
pituitary gland 33 / 17986 -- 379 / 145854 -- 33 / 17986 -- 379 / 145854 --
placenta 18 / 37653 -- 665 / 292212 -- 18 / 37653 -- 665 / 292212 --
pooled tissue 41 / 99675 -- -- -- 41 / 99675 -- -- --
prostate 83 / 23701   1401 / 386047 -- 83 / 23701 0 / 5 1401 / 386047 --
retina 47 / 82470 -- 1055 / 636203 -- 47 / 82470 -- 1055 / 636203 --
salivary gland 25 / 18434   -- -- 25 / 18434 0 / 958 -- --
skin 58 / 85891 31 / 31511 1758 / 615945 163 / 57574 58 / 85891 31 / 31511 1758 / 615945 163 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 78 / 73492 46 / 17831 1028 / 386635 -- 78 / 73492 46 / 17831 1028 / 386635 --
stem cell -- -- 761 / 234473 -- -- -- 761 / 234473 --
stomach 20 / 21241 -- 939 / 218318 -- 20 / 21241 -- 939 / 218318 --
synovium 3 / 16875 -- -- -- 3 / 16875 -- -- --
testis 142 / 116987 4 / 2634 1386 / 736319 -- 142 / 116987 4 / 2634 1386 / 736319 --
thymus 116 / 100203 27 / 20273 1267 / 346181 -- 116 / 100203 27 / 20273 1267 / 346181 --
thyroid 3 / 8821 -- -- -- 3 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 538 / 262740 26 / 14058 216 / 25954 -- 538 / 262740 26 / 14058 216 / 25954 --
uterus   -- 807 / 206823 -- 0 / 6854 -- 807 / 206823 --
vascular 2 / 12366 -- 2202 / 1092595 -- 2 / 12366 -- 2202 / 1092595 --
white blood cells -- -- 2112 / 398838 -- -- -- 2112 / 398838 --
whole body -- -- 1157 / 531904 1493 / 212613 -- -- 1157 / 531904 1493 / 212613