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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.13445Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 749 / 3259021 119 / 403641 1573 / 25718729 13 / 491920 749 / 3259021 119 / 403641 1573 / 25718729 13 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 9 / 38915 -- 3 / 64924 -- 9 / 38915 -- 3 / 64924 --
bone marrow 15 / 100926 --   -- 15 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 58 / 261599   417 / 7554651 -- 58 / 261599 0 / 2128 417 / 7554651 --
cartilage 1 / 266 -- -- -- 1 / 266 -- -- --
cerebellum 7 / 56549 -- 27 / 233710 2 / 43127 7 / 56549 -- 27 / 233710 2 / 43127
cerebrum 102 / 228104 -- -- -- 102 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 6 / 51804   -- -- 6 / 51804 0 / 689 -- --
ear 4 / 39315 -- -- -- 4 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 99 / 718928 1 / 9837 108 / 2760977 -- 99 / 718928 1 / 9837 108 / 2760977 --
endocrine 2 / 2473 -- -- -- 2 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 9 / 211918 -- -- -- 9 / 211918 --
eye 22 / 94929 -- 3 / 138066 -- 22 / 94929 -- 3 / 138066 --
gastrointestinal tract 2 / 34979 -- 37 / 548222 -- 2 / 34979 -- 37 / 548222 --
heart 21 / 49793 -- 59 / 1231698 -- 21 / 49793 -- 59 / 1231698 --
kidney 168 / 121184 3 / 2215 432 / 1415985 -- 168 / 121184 3 / 2215 432 / 1415985 --
limb 1 / 16187 -- 31 / 595880 -- 1 / 16187 -- 31 / 595880 --
liver 9 / 104633   2 / 527425 -- 9 / 104633 0 / 6685 2 / 527425 --
lung 2 / 26861 13 / 72516 56 / 943009 -- 2 / 26861 13 / 72516 56 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 8 / 344354 -- 1 / 14648 -- 8 / 344354 --
lymphoreticular   2 / 5421 -- -- 0 / 3137 2 / 5421 -- --
mammary gland 22 / 85464 59 / 216846 89 / 960632 4 / 178606 22 / 85464 59 / 216846 89 / 960632 4 / 178606
muscle 10 / 24130 -- 18 / 137075 -- 10 / 24130 -- 18 / 137075 --
nervous 7 / 35780 -- -- -- 7 / 35780 -- -- --
ovary 3 / 43149 -- 14 / 354066 -- 3 / 43149 -- 14 / 354066 --
pancreas 15 / 75220   35 / 1338446 -- 15 / 75220 0 / 34 35 / 1338446 --
pancreatic islet 1 / 30771 -- -- -- 1 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 5 / 9981 -- -- -- 5 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 2 / 17986 -- 2 / 145854 -- 2 / 17986 -- 2 / 145854 --
placenta   -- 5 / 292212 -- 0 / 37653 -- 5 / 292212 --
pooled tissue 15 / 99675 -- -- -- 15 / 99675 -- -- --
prostate 6 / 23701   18 / 386047 -- 6 / 23701 0 / 5 18 / 386047 --
retina 13 / 82470 -- 32 / 636203 -- 13 / 82470 -- 32 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434 1 / 958 -- -- 1 / 18434 1 / 958 -- --
skin 21 / 85891 14 / 31511 48 / 615945 2 / 57574 21 / 85891 14 / 31511 48 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 2 / 73492 13 / 17831 10 / 386635 -- 2 / 73492 13 / 17831 10 / 386635 --
stem cell -- -- 3 / 234473 -- -- -- 3 / 234473 --
stomach 4 / 21241 -- 20 / 218318 -- 4 / 21241 -- 20 / 218318 --
synovium 5 / 16875 -- -- -- 5 / 16875 -- -- --
testis 12 / 116987   24 / 736319 -- 12 / 116987 0 / 2634 24 / 736319 --
thymus 9 / 100203 4 / 20273 14 / 346181 -- 9 / 100203 4 / 20273 14 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 62 / 262740 9 / 14058   -- 62 / 262740 9 / 14058 0 / 25954 --
uterus 3 / 6854 -- 14 / 206823 -- 3 / 6854 -- 14 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 13 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 13 / 1092595 --
white blood cells -- -- 6 / 398838 -- -- -- 6 / 398838 --
whole body -- -- 16 / 531904 5 / 212613 -- -- 16 / 531904 5 / 212613