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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.133330Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 74 / 3259021 13 / 403641 177 / 25718729 3 / 491920 74 / 3259021 13 / 403641 177 / 25718729 3 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 1 / 38915 --   -- 1 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 3 / 261599   11 / 7554651 -- 3 / 261599 0 / 2128 11 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   --     0 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 4 / 51804   -- -- 4 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 19 / 718928 2 / 9837 63 / 2760977 -- 19 / 718928 2 / 9837 63 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 1 / 94929 --   -- 1 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 3 / 548222 -- 1 / 34979 -- 3 / 548222 --
heart   -- 1 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 1 / 1231698 --
kidney 4 / 121184   6 / 1415985 -- 4 / 121184 0 / 2215 6 / 1415985 --
limb   -- 9 / 595880 -- 0 / 16187 -- 9 / 595880 --
liver 3 / 104633 1 / 6685   -- 3 / 104633 1 / 6685 0 / 527425 --
lung 2 / 26861 3 / 72516 14 / 943009 -- 2 / 26861 3 / 72516 14 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland   7 / 216846 6 / 960632   0 / 85464 7 / 216846 6 / 960632 0 / 178606
muscle 2 / 24130 --   -- 2 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   --   -- 0 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas 4 / 75220   8 / 1338446 -- 4 / 75220 0 / 34 8 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 -- 1 / 145854 -- 1 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta   -- 4 / 292212 -- 0 / 37653 -- 4 / 292212 --
pooled tissue 4 / 99675 -- -- -- 4 / 99675 -- -- --
prostate     3 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 3 / 386047 --
retina   -- 1 / 636203 -- 0 / 82470 -- 1 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 9 / 85891   21 / 615945 3 / 57574 9 / 85891 0 / 31511 21 / 615945 3 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     1 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 1 / 386635 --
stem cell -- -- 5 / 234473 -- -- -- 5 / 234473 --
stomach   -- 5 / 218318 -- 0 / 21241 -- 5 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 1 / 116987   3 / 736319 -- 1 / 116987 0 / 2634 3 / 736319 --
thymus 10 / 100203   3 / 346181 -- 10 / 100203 0 / 20273 3 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 5 / 262740     -- 5 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 1 / 206823 -- 0 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular   -- 6 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 6 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 1 / 531904   -- -- 1 / 531904 0 / 212613