Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.132788Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 97 / 3259021 13 / 403641 173 / 25718729 2 / 491920 97 / 3259021 13 / 403641 173 / 25718729 2 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 6 / 100926 --   -- 6 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 16 / 261599   59 / 7554651 -- 16 / 261599 0 / 2128 59 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 2 / 56549 --     2 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 2 / 228104 -- -- -- 2 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 14 / 718928   21 / 2760977 -- 14 / 718928 0 / 9837 21 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 7 / 94929 -- 1 / 138066 -- 7 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 4 / 548222 -- 0 / 34979 -- 4 / 548222 --
heart 3 / 49793 -- 11 / 1231698 -- 3 / 49793 -- 11 / 1231698 --
kidney     9 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 9 / 1415985 --
limb 5 / 16187 -- 2 / 595880 -- 5 / 16187 -- 2 / 595880 --
liver     3 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 3 / 527425 --
lung 1 / 26861 4 / 72516 5 / 943009 -- 1 / 26861 4 / 72516 5 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 -- 2 / 344354 -- 2 / 14648 -- 2 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland   9 / 216846 9 / 960632   0 / 85464 9 / 216846 9 / 960632 0 / 178606
muscle 1 / 24130 --   -- 1 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 2 / 35780 -- -- -- 2 / 35780 -- -- --
ovary   -- 2 / 354066 -- 0 / 43149 -- 2 / 354066 --
pancreas 2 / 75220   5 / 1338446 -- 2 / 75220 0 / 34 5 / 1338446 --
pancreatic islet 1 / 30771 -- -- -- 1 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta 1 / 37653 --   -- 1 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 2 / 99675 -- -- -- 2 / 99675 -- -- --
prostate     5 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 5 / 386047 --
retina 3 / 82470 -- 5 / 636203 -- 3 / 82470 -- 5 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 8 / 85891   4 / 615945 1 / 57574 8 / 85891 0 / 31511 4 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 1 / 73492   3 / 386635 -- 1 / 73492 0 / 17831 3 / 386635 --
stem cell -- -- 1 / 234473 -- -- -- 1 / 234473 --
stomach   --   -- 0 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis 1 / 116987   8 / 736319 -- 1 / 116987 0 / 2634 8 / 736319 --
thymus 8 / 100203   3 / 346181 -- 8 / 100203 0 / 20273 3 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 6 / 262740     -- 6 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 1 / 206823 -- 0 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular 2 / 12366 -- 6 / 1092595 -- 2 / 12366 -- 6 / 1092595 --
white blood cells -- -- 1 / 398838 -- -- -- 1 / 398838 --
whole body -- -- 1 / 531904 1 / 212613 -- -- 1 / 531904 1 / 212613