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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.131530Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 122 / 3259021   623 / 25718729   122 / 3259021 0 / 403641 623 / 25718729 0 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 30 / 261599   559 / 7554651 -- 30 / 261599 0 / 2128 559 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 --     1 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 61 / 228104 -- -- -- 61 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 4 / 718928   6 / 2760977 -- 4 / 718928 0 / 9837 6 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye   --   -- 0 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 1 / 548222 -- 0 / 34979 -- 1 / 548222 --
heart 2 / 49793 -- 11 / 1231698 -- 2 / 49793 -- 11 / 1231698 --
kidney     3 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 3 / 1415985 --
limb 3 / 16187 -- 3 / 595880 -- 3 / 16187 -- 3 / 595880 --
liver     2 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 2 / 527425 --
lung     14 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 14 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 1 / 85464   1 / 960632   1 / 85464 0 / 216846 1 / 960632 0 / 178606
muscle 4 / 24130 -- 8 / 137075 -- 4 / 24130 -- 8 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   -- 1 / 354066 -- 0 / 43149 -- 1 / 354066 --
pancreas     1 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 1 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 12 / 99675 -- -- -- 12 / 99675 -- -- --
prostate     1 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 1 / 386047 --
retina 1 / 82470 --   -- 1 / 82470 -- 0 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin         0 / 85891 0 / 31511 0 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 1 / 73492     -- 1 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   -- 2 / 218318 -- 0 / 21241 -- 2 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     1 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 1 / 736319 --
thymus 2 / 100203     -- 2 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue       -- 0 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 3 / 206823 -- 0 / 6854 -- 3 / 206823 --
vascular   -- 5 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 5 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 1 / 531904   -- -- 1 / 531904 0 / 212613