Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.1292Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 11 / 3259021   153 / 25718729 4 / 491920 11 / 3259021 0 / 403641 153 / 25718729 4 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 1 / 261599   111 / 7554651 -- 1 / 261599 0 / 2128 111 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 --   1 / 43127 1 / 56549 -- 0 / 233710 1 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 4 / 718928   13 / 2760977 -- 4 / 718928 0 / 9837 13 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye   -- 2 / 138066 -- 0 / 94929 -- 2 / 138066 --
gastrointestinal tract   --   -- 0 / 34979 -- 0 / 548222 --
heart   -- 1 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 1 / 1231698 --
kidney     2 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 2 / 1415985 --
limb   -- 3 / 595880 -- 0 / 16187 -- 3 / 595880 --
liver       -- 0 / 104633 0 / 6685 0 / 527425 --
lung     2 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 2 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland       3 / 178606 0 / 85464 0 / 216846 0 / 960632 3 / 178606
muscle   -- 1 / 137075 -- 0 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 --   -- 1 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas     3 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 3 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 1 / 9981 -- -- -- 1 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   -- 1 / 292212 -- 0 / 37653 -- 1 / 292212 --
pooled tissue 2 / 99675 -- -- -- 2 / 99675 -- -- --
prostate     2 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 2 / 386047 --
retina   -- 4 / 636203 -- 0 / 82470 -- 4 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     2 / 615945   0 / 85891 0 / 31511 2 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen       -- 0 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   --   -- 0 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     4 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 4 / 736319 --
thymus       -- 0 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 1 / 262740     -- 1 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   --   -- 0 / 12366 -- 0 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 1 / 531904   -- -- 1 / 531904 0 / 212613