Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.12508Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 669 / 3259021 59 / 403641 3979 / 25718729 61 / 491920 669 / 3259021 59 / 403641 3979 / 25718729 61 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 6 / 38915 -- 10 / 64924 -- 6 / 38915 -- 10 / 64924 --
bone marrow 17 / 100926 -- 2 / 103390 -- 17 / 100926 -- 2 / 103390 --
brain 14 / 261599   671 / 7554651 -- 14 / 261599 0 / 2128 671 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 4 / 56549 -- 54 / 233710 2 / 43127 4 / 56549 -- 54 / 233710 2 / 43127
cerebrum 5 / 228104 -- -- -- 5 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 2 / 51804   -- -- 2 / 51804 0 / 689 -- --
ear 8 / 39315 -- -- -- 8 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 315 / 718928 6 / 9837 758 / 2760977 -- 315 / 718928 6 / 9837 758 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 9 / 211918 -- -- -- 9 / 211918 --
eye 22 / 94929 -- 36 / 138066 -- 22 / 94929 -- 36 / 138066 --
gastrointestinal tract 2 / 34979 -- 105 / 548222 -- 2 / 34979 -- 105 / 548222 --
heart 11 / 49793 -- 353 / 1231698 -- 11 / 49793 -- 353 / 1231698 --
kidney 17 / 121184   123 / 1415985 -- 17 / 121184 0 / 2215 123 / 1415985 --
limb   -- 120 / 595880 -- 0 / 16187 -- 120 / 595880 --
liver 9 / 104633 2 / 6685 83 / 527425 -- 9 / 104633 2 / 6685 83 / 527425 --
lung 1 / 26861 9 / 72516 280 / 943009 -- 1 / 26861 9 / 72516 280 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 18 / 344354 -- 1 / 14648 -- 18 / 344354 --
lymphoreticular   1 / 5421 -- -- 0 / 3137 1 / 5421 -- --
mammary gland 8 / 85464 30 / 216846 51 / 960632 15 / 178606 8 / 85464 30 / 216846 51 / 960632 15 / 178606
muscle 3 / 24130 -- 14 / 137075 -- 3 / 24130 -- 14 / 137075 --
nervous 8 / 35780 -- -- -- 8 / 35780 -- -- --
ovary 11 / 43149 -- 64 / 354066 -- 11 / 43149 -- 64 / 354066 --
pancreas 26 / 75220   120 / 1338446 -- 26 / 75220 0 / 34 120 / 1338446 --
pancreatic islet 2 / 30771 -- -- -- 2 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 4 / 17986 -- 3 / 145854 -- 4 / 17986 -- 3 / 145854 --
placenta   -- 15 / 292212 -- 0 / 37653 -- 15 / 292212 --
pooled tissue 5 / 99675 -- -- -- 5 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   23 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 23 / 386047 --
retina 36 / 82470 -- 206 / 636203 -- 36 / 82470 -- 206 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin   2 / 31511 73 / 615945 11 / 57574 0 / 85891 2 / 31511 73 / 615945 11 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 3 / 73492 5 / 17831 108 / 386635 -- 3 / 73492 5 / 17831 108 / 386635 --
stem cell -- -- 58 / 234473 -- -- -- 58 / 234473 --
stomach   -- 68 / 218318 -- 0 / 21241 -- 68 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis 36 / 116987 1 / 2634 273 / 736319 -- 36 / 116987 1 / 2634 273 / 736319 --
thymus 13 / 100203 3 / 20273 112 / 346181 -- 13 / 100203 3 / 20273 112 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 76 / 262740     -- 76 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 30 / 206823 -- 0 / 6854 -- 30 / 206823 --
vascular   -- 35 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 35 / 1092595 --
white blood cells -- -- 15 / 398838 -- -- -- 15 / 398838 --
whole body -- -- 89 / 531904 33 / 212613 -- -- 89 / 531904 33 / 212613