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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.123110Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 916 / 3259021 49 / 403641 1429 / 25718729 33 / 491920 916 / 3259021 49 / 403641 1429 / 25718729 33 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 15 / 38915 -- 2 / 64924 -- 15 / 38915 -- 2 / 64924 --
bone marrow 109 / 100926 -- 1 / 103390 -- 109 / 100926 -- 1 / 103390 --
brain 120 / 261599   521 / 7554651 -- 120 / 261599 0 / 2128 521 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 17 / 56549 -- 23 / 233710 2 / 43127 17 / 56549 -- 23 / 233710 2 / 43127
cerebrum 41 / 228104 -- -- -- 41 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 11 / 51804   -- -- 11 / 51804 0 / 689 -- --
ear 7 / 39315 -- -- -- 7 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 200 / 718928   91 / 2760977 -- 200 / 718928 0 / 9837 91 / 2760977 --
endocrine 1 / 2473 -- -- -- 1 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 32 / 94929 -- 2 / 138066 -- 32 / 94929 -- 2 / 138066 --
gastrointestinal tract 4 / 34979 -- 29 / 548222 -- 4 / 34979 -- 29 / 548222 --
heart 22 / 49793 -- 51 / 1231698 -- 22 / 49793 -- 51 / 1231698 --
kidney 34 / 121184   50 / 1415985 -- 34 / 121184 0 / 2215 50 / 1415985 --
limb   -- 18 / 595880 -- 0 / 16187 -- 18 / 595880 --
liver 7 / 104633 1 / 6685 5 / 527425 -- 7 / 104633 1 / 6685 5 / 527425 --
lung 20 / 26861 5 / 72516 72 / 943009 -- 20 / 26861 5 / 72516 72 / 943009 --
lymph node   -- 6 / 344354 -- 0 / 14648 -- 6 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 25 / 85464 41 / 216846 48 / 960632 8 / 178606 25 / 85464 41 / 216846 48 / 960632 8 / 178606
muscle 6 / 24130 -- 7 / 137075 -- 6 / 24130 -- 7 / 137075 --
nervous 8 / 35780 -- -- -- 8 / 35780 -- -- --
ovary 6 / 43149 -- 14 / 354066 -- 6 / 43149 -- 14 / 354066 --
pancreas 2 / 75220   37 / 1338446 -- 2 / 75220 0 / 34 37 / 1338446 --
pancreatic islet 9 / 30771 -- -- -- 9 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 8 / 9981 -- -- -- 8 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 5 / 17986 -- 1 / 145854 -- 5 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 2 / 292212 -- 2 / 37653 -- 2 / 292212 --
pooled tissue 15 / 99675 -- -- -- 15 / 99675 -- -- --
prostate     15 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 15 / 386047 --
retina 14 / 82470 -- 17 / 636203 -- 14 / 82470 -- 17 / 636203 --
salivary gland 3 / 18434   -- -- 3 / 18434 0 / 958 -- --
skin 10 / 85891 2 / 31511 31 / 615945 8 / 57574 10 / 85891 2 / 31511 31 / 615945 8 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 20 / 73492   7 / 386635 -- 20 / 73492 0 / 17831 7 / 386635 --
stem cell -- -- 5 / 234473 -- -- -- 5 / 234473 --
stomach   -- 6 / 218318 -- 0 / 21241 -- 6 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis 10 / 116987   25 / 736319 -- 10 / 116987 0 / 2634 25 / 736319 --
thymus 21 / 100203   10 / 346181 -- 21 / 100203 0 / 20273 10 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 100 / 262740   9 / 25954 -- 100 / 262740 0 / 14058 9 / 25954 --
uterus 3 / 6854 -- 8 / 206823 -- 3 / 6854 -- 8 / 206823 --
vascular 7 / 12366 -- 294 / 1092595 -- 7 / 12366 -- 294 / 1092595 --
white blood cells -- -- 16 / 398838 -- -- -- 16 / 398838 --
whole body -- -- 5 / 531904 15 / 212613 -- -- 5 / 531904 15 / 212613