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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.121508Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 65 / 3259021   84 / 25718729 1 / 491920 65 / 3259021 0 / 403641 84 / 25718729 1 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 27 / 261599   58 / 7554651 -- 27 / 261599 0 / 2128 58 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 1 / 233710   0 / 56549 -- 1 / 233710 0 / 43127
cerebrum 11 / 228104 -- -- -- 11 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 11 / 718928   9 / 2760977 -- 11 / 718928 0 / 9837 9 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 1 / 94929 -- 1 / 138066 -- 1 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 1 / 548222 -- 0 / 34979 -- 1 / 548222 --
heart   -- 1 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 1 / 1231698 --
kidney     1 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 1 / 1415985 --
limb   -- 3 / 595880 -- 0 / 16187 -- 3 / 595880 --
liver       -- 0 / 104633 0 / 6685 0 / 527425 --
lung     1 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 1 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland       1 / 178606 0 / 85464 0 / 216846 0 / 960632 1 / 178606
muscle   -- 3 / 137075 -- 0 / 24130 -- 3 / 137075 --
nervous 3 / 35780 -- -- -- 3 / 35780 -- -- --
ovary 2 / 43149 --   -- 2 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas     2 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 2 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 7 / 99675 -- -- -- 7 / 99675 -- -- --
prostate       -- 0 / 23701 0 / 5 0 / 386047 --
retina 2 / 82470 -- 3 / 636203 -- 2 / 82470 -- 3 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin         0 / 85891 0 / 31511 0 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen       -- 0 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   --   -- 0 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis       -- 0 / 116987 0 / 2634 0 / 736319 --
thymus       -- 0 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 1 / 262740     -- 1 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   --   -- 0 / 12366 -- 0 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- --     -- -- 0 / 531904 0 / 212613