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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.12144Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 97 / 3259021 6 / 403641 4678 / 25718729 47 / 491920 97 / 3259021 6 / 403641 4678 / 25718729 47 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 -- 5 / 64924 -- 2 / 38915 -- 5 / 64924 --
bone marrow 2 / 100926 -- 9 / 103390 -- 2 / 100926 -- 9 / 103390 --
brain 9 / 261599   2480 / 7554651 -- 9 / 261599 0 / 2128 2480 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 -- 13 / 233710 4 / 43127 1 / 56549 -- 13 / 233710 4 / 43127
cerebrum 5 / 228104 -- -- -- 5 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804   -- -- 1 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 9 / 718928 1 / 9837 403 / 2760977 -- 9 / 718928 1 / 9837 403 / 2760977 --
endocrine 1 / 2473 -- -- -- 1 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 52 / 211918 -- -- -- 52 / 211918 --
eye 4 / 94929 -- 20 / 138066 -- 4 / 94929 -- 20 / 138066 --
gastrointestinal tract 6 / 34979 -- 94 / 548222 -- 6 / 34979 -- 94 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 202 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 202 / 1231698 --
kidney 10 / 121184   105 / 1415985 -- 10 / 121184 0 / 2215 105 / 1415985 --
limb 1 / 16187 -- 88 / 595880 -- 1 / 16187 -- 88 / 595880 --
liver 1 / 104633   45 / 527425 -- 1 / 104633 0 / 6685 45 / 527425 --
lung 1 / 26861 2 / 72516 107 / 943009 -- 1 / 26861 2 / 72516 107 / 943009 --
lymph node   -- 43 / 344354 -- 0 / 14648 -- 43 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 4 / 85464 1 / 216846 59 / 960632 4 / 178606 4 / 85464 1 / 216846 59 / 960632 4 / 178606
muscle   -- 16 / 137075 -- 0 / 24130 -- 16 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 -- 76 / 354066 -- 1 / 43149 -- 76 / 354066 --
pancreas 8 / 75220   256 / 1338446 -- 8 / 75220 0 / 34 256 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 18 / 145854 -- 0 / 17986 -- 18 / 145854 --
placenta 1 / 37653 -- 29 / 292212 -- 1 / 37653 -- 29 / 292212 --
pooled tissue 10 / 99675 -- -- -- 10 / 99675 -- -- --
prostate 2 / 23701   18 / 386047 -- 2 / 23701 0 / 5 18 / 386047 --
retina 1 / 82470 -- 29 / 636203 -- 1 / 82470 -- 29 / 636203 --
salivary gland   1 / 958 -- -- 0 / 18434 1 / 958 -- --
skin     69 / 615945 3 / 57574 0 / 85891 0 / 31511 69 / 615945 3 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     39 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 39 / 386635 --
stem cell -- -- 39 / 234473 -- -- -- 39 / 234473 --
stomach 1 / 21241 -- 36 / 218318 -- 1 / 21241 -- 36 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 8 / 116987   57 / 736319 -- 8 / 116987 0 / 2634 57 / 736319 --
thymus 4 / 100203   56 / 346181 -- 4 / 100203 0 / 20273 56 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 2 / 262740 1 / 14058 3 / 25954 -- 2 / 262740 1 / 14058 3 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 18 / 206823 -- 1 / 6854 -- 18 / 206823 --
vascular   -- 108 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 108 / 1092595 --
white blood cells -- -- 21 / 398838 -- -- -- 21 / 398838 --
whole body -- -- 65 / 531904 36 / 212613 -- -- 65 / 531904 36 / 212613