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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.116Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 33 / 3259021   337 / 25718729 10 / 491920 33 / 3259021 0 / 403641 337 / 25718729 10 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 1 / 64924 -- 0 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow   -- 4 / 103390 -- 0 / 100926 -- 4 / 103390 --
brain 2 / 261599   49 / 7554651 -- 2 / 261599 0 / 2128 49 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 6 / 233710   0 / 56549 -- 6 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue     40 / 2760977 -- 0 / 718928 0 / 9837 40 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 5 / 211918 -- -- -- 5 / 211918 --
eye   --   -- 0 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 15 / 548222 -- 0 / 34979 -- 15 / 548222 --
heart   -- 7 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 7 / 1231698 --
kidney     17 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 17 / 1415985 --
limb   -- 14 / 595880 -- 0 / 16187 -- 14 / 595880 --
liver     1 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 1 / 527425 --
lung     11 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 11 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 -- 31 / 344354 -- 2 / 14648 -- 31 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 4 / 85464   8 / 960632 4 / 178606 4 / 85464 0 / 216846 8 / 960632 4 / 178606
muscle   -- 2 / 137075 -- 0 / 24130 -- 2 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 2 / 43149 -- 1 / 354066 -- 2 / 43149 -- 1 / 354066 --
pancreas     8 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 8 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 2 / 145854 -- 0 / 17986 -- 2 / 145854 --
placenta   -- 4 / 292212 -- 0 / 37653 -- 4 / 292212 --
pooled tissue   -- -- -- 0 / 99675 -- -- --
prostate     7 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 7 / 386047 --
retina   -- 16 / 636203 -- 0 / 82470 -- 16 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     16 / 615945 2 / 57574 0 / 85891 0 / 31511 16 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 10 / 73492   15 / 386635 -- 10 / 73492 0 / 17831 15 / 386635 --
stem cell -- -- 2 / 234473 -- -- -- 2 / 234473 --
stomach   -- 2 / 218318 -- 0 / 21241 -- 2 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     11 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 11 / 736319 --
thymus 7 / 100203   12 / 346181 -- 7 / 100203 0 / 20273 12 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 6 / 262740   1 / 25954 -- 6 / 262740 0 / 14058 1 / 25954 --
uterus   -- 3 / 206823 -- 0 / 6854 -- 3 / 206823 --
vascular   -- 9 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 9 / 1092595 --
white blood cells -- -- 13 / 398838 -- -- -- 13 / 398838 --
whole body -- -- 4 / 531904 4 / 212613 -- -- 4 / 531904 4 / 212613