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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.109840Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 115 / 3259021 10 / 403641 375 / 25718729 3 / 491920 115 / 3259021 10 / 403641 375 / 25718729 3 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 1 / 64924 -- 0 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow   -- 2 / 103390 -- 0 / 100926 -- 2 / 103390 --
brain 5 / 261599   114 / 7554651 -- 5 / 261599 0 / 2128 114 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 --     1 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 35 / 228104 -- -- -- 35 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 7 / 718928   22 / 2760977 -- 7 / 718928 0 / 9837 22 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 3 / 94929 --   -- 3 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   --   -- 0 / 34979 -- 0 / 548222 --
heart   -- 4 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 4 / 1231698 --
kidney 6 / 121184   16 / 1415985 -- 6 / 121184 0 / 2215 16 / 1415985 --
limb   -- 1 / 595880 -- 0 / 16187 -- 1 / 595880 --
liver       -- 0 / 104633 0 / 6685 0 / 527425 --
lung 1 / 26861 2 / 72516 16 / 943009 -- 1 / 26861 2 / 72516 16 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 5 / 85464 6 / 216846 1 / 960632 1 / 178606 5 / 85464 6 / 216846 1 / 960632 1 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 4 / 35780 -- -- -- 4 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 -- 10 / 354066 -- 1 / 43149 -- 10 / 354066 --
pancreas 8 / 75220   87 / 1338446 -- 8 / 75220 0 / 34 87 / 1338446 --
pancreatic islet 1 / 30771 -- -- -- 1 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 3 / 17986 -- 2 / 145854 -- 3 / 17986 -- 2 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 5 / 99675 -- -- -- 5 / 99675 -- -- --
prostate     13 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 13 / 386047 --
retina 13 / 82470 -- 37 / 636203 -- 13 / 82470 -- 37 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 1 / 85891 2 / 31511 5 / 615945   1 / 85891 2 / 31511 5 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     1 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 1 / 386635 --
stem cell -- -- 2 / 234473 -- -- -- 2 / 234473 --
stomach 4 / 21241 -- 3 / 218318 -- 4 / 21241 -- 3 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 3 / 116987   25 / 736319 -- 3 / 116987 0 / 2634 25 / 736319 --
thymus       -- 0 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 8 / 262740     -- 8 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 3 / 206823 -- 0 / 6854 -- 3 / 206823 --
vascular   -- 5 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 5 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 5 / 531904 2 / 212613 -- -- 5 / 531904 2 / 212613