Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.101034Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 177 / 3259021 77 / 403641 972 / 25718729 34 / 491920 177 / 3259021 77 / 403641 972 / 25718729 34 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 41 / 100926 -- 6 / 103390 -- 41 / 100926 -- 6 / 103390 --
brain 1 / 261599   35 / 7554651 -- 1 / 261599 0 / 2128 35 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 14 / 233710   0 / 56549 -- 14 / 233710 0 / 43127
cerebrum 2 / 228104 -- -- -- 2 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 2 / 51804   -- -- 2 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 52 / 718928   287 / 2760977 -- 52 / 718928 0 / 9837 287 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 3 / 94929 -- 8 / 138066 -- 3 / 94929 -- 8 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 21 / 548222 -- 0 / 34979 -- 21 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 28 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 28 / 1231698 --
kidney 5 / 121184 2 / 2215 44 / 1415985 -- 5 / 121184 2 / 2215 44 / 1415985 --
limb   -- 23 / 595880 -- 0 / 16187 -- 23 / 595880 --
liver 7 / 104633   11 / 527425 -- 7 / 104633 0 / 6685 11 / 527425 --
lung 1 / 26861 12 / 72516 64 / 943009 -- 1 / 26861 12 / 72516 64 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 -- 3 / 344354 -- 2 / 14648 -- 3 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 12 / 85464 60 / 216846 77 / 960632 29 / 178606 12 / 85464 60 / 216846 77 / 960632 29 / 178606
muscle 4 / 24130 -- 2 / 137075 -- 4 / 24130 -- 2 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 6 / 43149 -- 26 / 354066 -- 6 / 43149 -- 26 / 354066 --
pancreas 1 / 75220   28 / 1338446 -- 1 / 75220 0 / 34 28 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 -- 1 / 145854 -- 1 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta   -- 8 / 292212 -- 0 / 37653 -- 8 / 292212 --
pooled tissue 3 / 99675 -- -- -- 3 / 99675 -- -- --
prostate     12 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 12 / 386047 --
retina 1 / 82470 -- 19 / 636203 -- 1 / 82470 -- 19 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434   -- -- 1 / 18434 0 / 958 -- --
skin 1 / 85891 1 / 31511 31 / 615945 2 / 57574 1 / 85891 1 / 31511 31 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 4 / 73492   33 / 386635 -- 4 / 73492 0 / 17831 33 / 386635 --
stem cell -- -- 17 / 234473 -- -- -- 17 / 234473 --
stomach 1 / 21241 -- 12 / 218318 -- 1 / 21241 -- 12 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 4 / 116987   100 / 736319 -- 4 / 116987 0 / 2634 100 / 736319 --
thymus 5 / 100203 2 / 20273 16 / 346181 -- 5 / 100203 2 / 20273 16 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 13 / 262740     -- 13 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 16 / 206823 -- 1 / 6854 -- 16 / 206823 --
vascular   -- 13 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 13 / 1092595 --
white blood cells -- -- 5 / 398838 -- -- -- 5 / 398838 --
whole body -- -- 11 / 531904 3 / 212613 -- -- 11 / 531904 3 / 212613