Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.9825Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 146 / 3316537 141 / 2498449 2767 / 114162531 4199 / 109592465 146 / 3316537 141 / 2498449 2767 / 114162531 4199 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   3 / 57865 -- 5 / 83577 0 / 16077 3 / 57865 -- 5 / 83577
bone marrow   4 / 29891 24 / 5047110 63 / 4978364 0 / 14774 4 / 29891 24 / 5047110 63 / 4978364
brain 12 / 506301 14 / 200215 30 / 729526 455 / 4997811 12 / 506301 14 / 200215 30 / 729526 455 / 4997811
cartilage     -- 80 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 80 / 778035
cerebellum 1 / 90353   4 / 90885 103 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 4 / 90885 103 / 1495938
cerebrum 4 / 198932   -- -- 4 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   5 / 44577 -- -- 0 / 3888 5 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 11 / 151167 4 / 98089 30 / 643586 1 / 26551 11 / 151167 4 / 98089 30 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 6 / 246043   -- -- 6 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 9 / 128826 7 / 46440 8 / 85898 73 / 12434232 9 / 128826 7 / 46440 8 / 85898 73 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 2 / 76442   7 / 83063 -- 2 / 76442 0 / 1 7 / 83063 --
kidney 3 / 106627 9 / 89898 8 / 155372 3 / 100281 3 / 106627 9 / 89898 8 / 155372 3 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 4 / 96846   7 / 66308 10 / 214987 4 / 96846 0 / 107249 7 / 66308 10 / 214987
lung 9 / 128150 8 / 170663 13 / 159917 15 / 159059 9 / 128150 8 / 170663 13 / 159917 15 / 159059
lymph node 4 / 62650   300 / 5278419 111 / 4863489 4 / 62650 0 / 27007 300 / 5278419 111 / 4863489
lymphoreticular   2 / 44303 -- -- 0 / 17836 2 / 44303 -- --
mammary gland   7 / 104307 930 / 43166038 2107 / 30312656 0 / 46553 7 / 104307 930 / 43166038 2107 / 30312656
muscle 1 / 74039 2 / 27691 6 / 107836 3 / 61270 1 / 74039 2 / 27691 6 / 107836 3 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   6 / 89988 5 / 94887 5 / 179472 0 / 11462 6 / 89988 5 / 94887 5 / 179472
pancreas 4 / 7237 5 / 74930 4 / 85728 17 / 189999 4 / 7237 5 / 74930 4 / 85728 17 / 189999
pancreatic islet 22 / 96524 6 / 30072 -- -- 22 / 96524 6 / 30072 -- --
parathyroid   2 / 20557 -- -- 0 / 24 2 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 11 / 241088 1 / 39531 8 / 207348 -- 11 / 241088 1 / 39531 8 / 207348 --
pooled tissue 20 / 276455   -- -- 20 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 5 / 79993 6 / 107080 34 / 266949 38 / 491794 5 / 79993 6 / 107080 34 / 266949 38 / 491794
retina   -- 34 / 820326 4 / 88490 0 / 29438 -- 34 / 820326 4 / 88490
salivary gland   3 / 10368 -- -- 0 / 2490 3 / 10368 -- --
skin 9 / 73633 16 / 125377 213 / 26905847 650 / 34522313 9 / 73633 16 / 125377 213 / 26905847 650 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 191 / 6230144 -- -- -- 191 / 6230144 --
stomach   1 / 65644   37 / 448716 0 / 26641 1 / 65644 0 / 124767 37 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 10 / 143630 1 / 100058 -- 375 / 12372003 10 / 143630 1 / 100058 -- 375 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606 8 / 115938 9 / 124664 0 / 11737 1 / 32606 8 / 115938 9 / 124664
uncharacterized tissue 3 / 207932 5 / 479819 1 / 21833 6 / 51729 3 / 207932 5 / 479819 1 / 21833 6 / 51729
uterus 1 / 38063 15 / 133582 321 / 10193077 -- 1 / 38063 15 / 133582 321 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 570 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 570 / 13135050 --
white blood cells -- -- 37 / 846268 -- -- -- 37 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --