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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.96Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 80 / 3316537 76 / 2498449 2120 / 114162531 4748 / 109592465 80 / 3316537 76 / 2498449 2120 / 114162531 4748 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   3 / 57865 --   0 / 16077 3 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 2 / 14774 2 / 29891 113 / 5047110 272 / 4978364 2 / 14774 2 / 29891 113 / 5047110 272 / 4978364
brain 4 / 506301 12 / 200215 3 / 729526 43 / 4997811 4 / 506301 12 / 200215 3 / 729526 43 / 4997811
cartilage     -- 8 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 8 / 778035
cerebellum       5 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 5 / 1495938
cerebrum 1 / 198932   -- -- 1 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   1 / 44577 -- -- 0 / 3888 1 / 44577 -- --
colon   3 / 151167   6 / 643586 0 / 26551 3 / 151167 0 / 98089 6 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 21 / 246043   -- -- 21 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye   3 / 46440   327 / 12434232 0 / 128826 3 / 46440 0 / 85898 327 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 1 / 106627 1 / 89898   1 / 100281 1 / 106627 1 / 89898 0 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846 2 / 107249   2 / 214987 2 / 96846 2 / 107249 0 / 66308 2 / 214987
lung 4 / 128150 5 / 170663   3 / 159059 4 / 128150 5 / 170663 0 / 159917 3 / 159059
lymph node 8 / 62650   49 / 5278419 118 / 4863489 8 / 62650 0 / 27007 49 / 5278419 118 / 4863489
lymphoreticular   1 / 44303 -- -- 0 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland   2 / 104307 605 / 43166038 3241 / 30312656 0 / 46553 2 / 104307 605 / 43166038 3241 / 30312656
muscle 1 / 74039       1 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   4 / 89988 1 / 94887   0 / 11462 4 / 89988 1 / 94887 0 / 179472
pancreas     5 / 85728 3 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 5 / 85728 3 / 189999
pancreatic islet 5 / 96524   -- -- 5 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 13 / 241088   2 / 207348 -- 13 / 241088 0 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 6 / 276455   -- -- 6 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   1 / 107080 1 / 266949 8 / 491794 0 / 79993 1 / 107080 1 / 266949 8 / 491794
retina   --   1 / 88490 0 / 29438 -- 0 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 1 / 73633 2 / 125377 164 / 26905847 162 / 34522313 1 / 73633 2 / 125377 164 / 26905847 162 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 1019 / 6230144 -- -- -- 1019 / 6230144 --
stomach     1 / 124767 6 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 1 / 124767 6 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 1 / 143630 7 / 100058 -- 538 / 12372003 1 / 143630 7 / 100058 -- 538 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid       1 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 9 / 207932 22 / 479819 2 / 21833 3 / 51729 9 / 207932 22 / 479819 2 / 21833 3 / 51729
uterus   4 / 133582 15 / 10193077 -- 0 / 38063 4 / 133582 15 / 10193077 --
vascular   -- 114 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 114 / 13135050 --
white blood cells -- -- 26 / 846268 -- -- -- 26 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --