Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.95008Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 358 / 3316537 13 / 2498449 1931 / 114162531 46 / 109592465 358 / 3316537 13 / 2498449 1931 / 114162531 46 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   1 / 57865 --   0 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     3 / 5047110   0 / 14774 0 / 29891 3 / 5047110 0 / 4978364
brain 1 / 506301   2 / 729526 11 / 4997811 1 / 506301 0 / 200215 2 / 729526 11 / 4997811
cartilage     -- 6 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 6 / 778035
cerebellum     1 / 90885   0 / 90353 0 / 0 1 / 90885 0 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 1 / 26551     1 / 643586 1 / 26551 0 / 151167 0 / 98089 1 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 11 / 246043   -- -- 11 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 2 / 128826   1 / 85898   2 / 128826 0 / 46440 1 / 85898 0 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 2 / 76442     -- 2 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney         0 / 106627 0 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver       1 / 214987 0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 1 / 214987
lung 2 / 128150   1 / 159917   2 / 128150 0 / 170663 1 / 159917 0 / 159059
lymph node         0 / 62650 0 / 27007 0 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     29 / 43166038 18 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 29 / 43166038 18 / 30312656
muscle     1 / 107836   0 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary       4 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 4 / 179472
pancreas       2 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 2 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 330 / 241088   1878 / 207348 -- 330 / 241088 0 / 39531 1878 / 207348 --
pooled tissue 7 / 276455   -- -- 7 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993       2 / 79993 0 / 107080 0 / 266949 0 / 491794
retina   --   1 / 88490 0 / 29438 -- 0 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   12 / 125377     0 / 73633 12 / 125377 0 / 26905847 0 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 11 / 6230144 -- -- -- 11 / 6230144 --
stomach       1 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 1 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     --   0 / 143630 0 / 100058 -- 0 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid       1 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue         0 / 207932 0 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus     3 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 3 / 10193077 --
vascular   --   -- 0 / 46250 -- 0 / 13135050 --
white blood cells -- -- 1 / 846268 -- -- -- 1 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --