Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.93907Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES     1470 / 114162531 2173 / 109592465 0 / 3316537 0 / 2498449 1470 / 114162531 2173 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     5 / 5047110 4 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 5 / 5047110 4 / 4978364
brain     8 / 729526 193 / 4997811 0 / 506301 0 / 200215 8 / 729526 193 / 4997811
cartilage     -- 4 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 4 / 778035
cerebellum     3 / 90885 58 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 3 / 90885 58 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon     2 / 98089 2 / 643586 0 / 26551 0 / 151167 2 / 98089 2 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye     1 / 85898 432 / 12434232 0 / 128826 0 / 46440 1 / 85898 432 / 12434232
gastrointestinal tract     2 / 45908 -- 0 / 28803 0 / 12721 2 / 45908 --
heart     2 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney         0 / 106627 0 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver       4 / 214987 0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 4 / 214987
lung     4 / 159917 4 / 159059 0 / 128150 0 / 170663 4 / 159917 4 / 159059
lymph node     145 / 5278419 17 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 145 / 5278419 17 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     57 / 43166038 548 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 57 / 43166038 548 / 30312656
muscle       2 / 61270 0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 2 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary     1 / 94887 1 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 1 / 94887 1 / 179472
pancreas     2 / 85728 2 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 2 / 85728 2 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta     11 / 207348 -- 0 / 241088 0 / 39531 11 / 207348 --
pooled tissue     -- -- 0 / 276455 0 / 0 -- --
prostate     1 / 266949 4 / 491794 0 / 79993 0 / 107080 1 / 266949 4 / 491794
retina   -- 27 / 820326 6 / 88490 0 / 29438 -- 27 / 820326 6 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     683 / 26905847 743 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 683 / 26905847 743 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 59 / 6230144 -- -- -- 59 / 6230144 --
stomach     3 / 124767 13 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 3 / 124767 13 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     -- 130 / 12372003 0 / 143630 0 / 100058 -- 130 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     5 / 115938 6 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 5 / 115938 6 / 124664
uncharacterized tissue         0 / 207932 0 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus     234 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 234 / 10193077 --
vascular   -- 206 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 206 / 13135050 --
white blood cells -- -- 9 / 846268 -- -- -- 9 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --